セキュリティーでおすすめの勤怠管理システム10選【2025年最新版】
勤怠管理システムを導入したいけどセキュリティー面が不安とお悩みの方も多いのでしょう。
そこでおすすめなのが、セキュリティーに強い勤怠管理システムを導入することです。
セキュリティー対策が万全ならば、不正アクセスなどを未然に防ぐことができます。
そこでこの記事では、営業・バックオフィス・情報システムなど、さまざまな分野の法人向けSaaSサービスを比較検討できる「PRONIアイミツ」が、セキュリティーでおすすめの勤怠管理システムを厳選してご紹介!
セキュリティー対策が万全な勤怠管理システムのメリットや勤怠管理システムの選び方も詳しく解説していきます。
- 勤怠管理システムにおけるセキュリティーの問題とは
- セキュリティー対策が万全の勤怠管理システムを導入するメリット
- 勤怠管理システムの選び方
- おすすめのセキュリティー対策が万全な勤怠管理システム10選
- 【まとめ】勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ

勤怠管理システムにおけるセキュリティーの問題とは
勤怠管理業務が大幅に効率化されるとして、業界や規模を問わず多くの企業に導入されているのが、勤怠管理システムです。
勤怠管理システムを導入すれば、
・毎日の出退勤の打刻
・勤怠データの一元管理
・休暇管理
・残業管理
・休暇や残業の申請・承認
・シフト管理
などをまとめて行えるほか、PCや打刻機のみならずスマートフォンやタブレットも利用してモバイル打刻を行えるなど、利便性が大きく高まります。
システムを導入すると便利になることはわかっていても、どうしてもセキュリティー面が気になるという場合も多いでしょう。従業員に関する個人情報を取り扱うこととなるため、万が一不正操作などが行われれば大問題です。
そのような事態となるのを未然に防ぐためにも、セキュリティー面の対策が整われている勤怠管理システムを選ばなければなりません。
セキュリティー対策が万全の勤怠管理システムを導入するメリット
セキュリティー対策が万全の勤怠管理システムを導入するとどのようなメリットがあるのかを確認しておきましょう。
セキュリティー面の対策が万全に整っていれば不正アクセスなどを防げるため、安心して利用できます。例えば、セキュリティー面の対策が万全に整っている勤怠管理システムの場合、以下のような機能が搭載されています。
・IPアドレス制限
・デバイス制限
・ワンタイムパスワード機能
・二段階認証機能
また、データベースの冗長化やインフラの監視、定期的な脆弱性診断、SQLインジェクション対策など、さまざま対策が行われていることが多いです。対策を講じていれば危険な第三者によるアクセスを徹底的に防げます。
もしもこのようなセキュリティー対策がとられていない場合には、第三者に勝手にログインされ、勤怠データを組み換えられてしまうなんてこともあるかもしれません。
勤怠管理システムの選び方
勤怠管理システムを選ぶ際には、以下のポイントを押さえておきましょう。
・操作性
まずチェックしたいのは、自社の従業員のITリテラシーに合うシステムかどうか。せっかく導入しても「使い方が分からない」という理由で敬遠されてしまっては意味がありません。無料お試し期間を提供している勤怠管理システムも多いので、積極的に利用して操作性を確認しましょう。
・料金プラン
勤怠管理システムは、利用人数・規模によって料金が変動します。価格の安さだけに目を向けるのではなく、自社のニーズに合うプランが提供されているかをチェックしましょう。
・サポート体制
勤怠管理システムは、全従業員がほとんど毎日利用する重要なツール。スムーズに運用できるよう、万が一のトラブルの際のサポート窓口の有無などを確認するとよいでしょう。
おすすめのセキュリティー対策が万全な勤怠管理システム10選
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料金
月300円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
KING OF TIMEは、使いやすさや豊富な機能、万全の運営体制などで多くの人気を集めている勤怠管理システムです。誰でも簡単に使いこなせるわかりやすい操作画面であるほか、打刻機能やシフト管理機能、休暇・残業管理機能、さらには勤怠データの分析などまで幅広い機能を搭載しています。セキュリティー面の対策が充実しているのも特徴の1つ。SQLインジェクション対策やクロスサイトスクリプティング対策などの不正アクセス対策が万全であるほか、データセンターやサーバー機器の二重化などを行っています。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
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導入当初に電話でのサポート、アプリ版についての問い合わせでチャットサポートを利用しましたが、どちらの際も対応がはやく、こちらの疑問点もすぐに解消することができました。
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自分は機械の操作がそれほど得意ではないのですが、そんな自分でもそれなりに時間をかけて調べながらなんなく作業できるところが非常にいいです。
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料金
月200円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
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最低利用人数
なし
ジョブカン勤怠管理は、はじめて導入する企業であっても簡単に使いこなせるとして、多くの人気を集めている勤怠管理システムです。シリーズ累計で12万社以上に導入されてきた実績を誇り、大手企業から中小企業、スタートアップまで幅広く導入されています。
セキュリティー面の対策も万全で、IP制限やワンタイムパスワード機能を用意しているほか、定期的な脆弱性診断を行い、クレジットカード情報は非保持。データベースの冗長化やインフラの監視体制なども整っています。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
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画面が直感的で、説明書がなくても使えるところがいいです。以前の勤怠管理システムは申請システムなど煩雑でしたが、今のシステムは申請も楽で良いです。
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画面が落ち着いた色表現方法を使用していて、分かりやすい感じだった。また、勤怠管理システムの使用が初めてでも分かりやすい。

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料金
月200円/ユーザー -
初期費用
なし
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
AKASHIは、初期費用は0円、月額利用料金は1ユーザーあたり200円(税抜)で利用できる勤怠管理システムです。打刻機能や工数管理機能、シフト管理機能、テレワークに特化した機能などを利用できるほか、サポート体制も充実。サポートチャットの満足度は、98.3%を記録しています。
セキュリティー面の対策としてはシングルサインオン機能を搭載しており、パスワードの紛失や不正アクセスのリスクを抑えられるのが安心できるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
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設定が簡単で使いやすい。 シンプルで見やすい。 チャットで質問が可能。 残業時間の管理が楽。 給与計算しやすく、不満なし。
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使い初めは皆さん戸惑いますが特にトラブルもなくスムーズに作業できています。 こちらを使いはじめてから作業効率が上がり助かっています。

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料金
月220円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
5人
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最低利用人数
なし
kinconeは、1ユーザーあたり200円(税抜)で利用できるリーズナブルさを叶えながら、さまざまな便利な機能を利用できる勤怠管理システムです。出退勤時にICカードを利用することにより、打刻するとともに交通費の記録も行えるほか、SlackやChatwork、LINE WORKSを活用したチャット打刻なども可能です。
セキュリティー対策については、細かな権限設定が行えるほか、パスワードポリシーも柔軟に設定できるなど、さまざまな機能を用意しています。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 英語
- 有給休暇の自動付与機能
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インターフェースが馴染みやすくて、覚えやすい。階層的でタスクを管理しやすい。また共有もしやすく発展性がある。
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画面が見やすく。文字の操作がやりやすい。 立ち上げてもすぐ起動する。フリーズしない為、かなり使いやすい。 他社にもお勧めしたい

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料金
月100円/ユーザー -
初期費用
0円
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最低利用期間
なし
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最低利用人数
1人
ハーモス勤怠(HRMOS勤怠)は、無料で利用もできる勤怠管理システムとして多くの企業に選ばれているシステムです。無料プランの場合でも打刻機能や日次勤怠管理(予実管理)、シフト管理機能などを期間・人数の制限なしで使えます。
2021年の5月にはiDaaS「HENNGE One」と連携し、シングルサインオン機能が使用可能に。IDやパスワードの管理が効率化されることによって、セキュリティー面のリスクを抑えることが可能です。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
-
操作が簡単で、おじさんにも使いやすい。特段、使い方の説明書がなくても、十分使いこなせる。申請し忘れたときの、催促のメールがうるさいし、煩わしい。
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無料で利用できるところが最大の良い点です。一般の利用者が使用する打刻画面はシンプルでわかりやすい。簡単な集計機能もありライトユーザーにはおすすめです。

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料金
月300円/ユーザー -
初期費用
0円
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
タッチオンタイムは、中小企業から大企業まで幅広く導入されている勤怠管理システムです。これまでの導入社数は2万8,000社にも及び、継続して使用する割合も99.7%と非常に優れたデータが残されています。
プライバシーマークやISMSの認証を取得しているほか、データの暗号化やデータベースの冗長化、SQLインジェクション対策、DDoS対策など、不正を防ぐセキュリティー対策が万全に敷かれている点が心強いでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- メールサポートあり
-
社員証をタッチすれば簡単に出退勤が管理できる。以前はタイムカードを使って物理的に出退勤を管理していたが有給申請の管理は別システムに頼らざるを得なかった。クラウドサービスでは先々の有給申請も簡単にできることから利便性は高まったと思う。
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文字通りタッチのみで勤怠管理できる。ネットを利用して自分の出勤状況をチェックでき、有給休暇等もネットから申請出来てストレスが少ない。

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料金
月200円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
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最低利用人数
1人
CLOUZAは、気軽に導入できる勤怠管理システムとして多くの人気を集めているサービスです。勤怠データをリアルタイムに集計できるほか、時間外労働の基準値を超えてしまった際にはアラートを通知、さらには有給の自動付与や管理を行えるなど、さまざまな機能が充実しています。
CLOUZA内で扱うデータについては、これまでに10年以上もの運用実績を誇るサーバーでセキュアに管理。プライバシーマークを取得している点が安心できるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- 打刻漏れアラート設定
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
- 申請のモバイルデバイス対応
- シフトの作成機能
- 有給休暇の自動付与機能
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他を知らないのでこれが一番使いやすい。説明書が比較的丁寧に書かれているため、教える人がいなくても最悪、自分でどうにかなるところも魅力的と思う。
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ユーザーインターフェースが良いと思います。最新バージョンでは、特に取扱い説明書など読まずとも、問題なく使用できます。

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料金
月30,000円 -
初期費用
なし
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最低利用期間
1ヶ月
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最低利用人数
1名
MINAGINE就業管理システムは、万全のサポート体制や、労働基準法改正への対応力、さらにはコストパフォーマンスの良さの三拍子が揃ったシステムです。業界や規模を問わず数多くの企業に導入されています。
2~3ヵ月もの時間をかけて行われるコンサルティングは、社労士資格も保有している担当者によって行われるなど、サポート面が充実している点が最大の魅力です。プライバシーマークをすでに取得済みであることから、個人情報の取り扱いも安心セキュリティー面が心配という方でも利用できるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
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シンプルで使いやすい。特に導入時からトラブルなく使用できており、新入社員などが入ってきてもすぐに理解して運用できている
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直感的で使いやすいです。導入には反対の声も多くありましたが、何度も何度も説明会を開いて導入にこぎつけました。

ラクロー
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料金
月500円/ユーザー -
初期費用
0円
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最低利用期間
1ヶ月
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最低利用人数
10人
ラクローは、PCのログオン・ログオフ機能を活用することによってより正確な勤怠管理を叶えている勤怠管理システムです。PCのログオン・ログオフのほか、メールを送信した日時、チャットツールの利用データなども参考にして労働時間を算出するため、労働時間を正確に把握したいという場合には非常に心強いでしょう。
情報セキュリティーマネジメントの国際規格であるISO 27001(ISMS)を取得しているほか、すべての通信を暗号化、第三者による脆弱性診断を受けているなど、セキュリティー面の対策も万全です。
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- メールサポートあり
- 英語
- 申請のモバイルデバイス対応
- 有給休暇の自動付与機能
- 時間外労働の上限超過アラート設定
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料金
月400円/人 -
初期費用
150,000円
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最低利用期間
50人
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最低利用人数
なし
TeamSpiritは、誰でも簡単に使いこなせる使いやすいインターフェースが人気の勤怠管理システムです。フレックスタイム制や変形労働時間制などさまざまな就業形態に対応できるほか、長時間労働を防ぐレポート機能も搭載しているなど、豊富な機能の数々も魅力でしょう。
システム内で扱うデータは、金融機関にも採用されているSalesforce Platform(PaaS)で管理。データセンターにおけるミラーリングや日次バックアップなどのセキュリティー対策も整っており、安心して利用可能です。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- メールサポートあり
- 英語
- 申請のモバイルデバイス対応
- 有給休暇の自動付与機能
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インターフェイスは分かりやすいし、有休休暇残数なども出てきて便利。それまではタイムカードだったので、総務も処理がラクになったようです。
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シフト制の変形労働や土日祝日休みの固定労働、フレックスに管理監督者と多様な形態にフレキシブルに対応していたため、導入しやすかったと感じています。 中でも独自の休暇制度についても管理できるようにアレンジできたのは業務軽減につながりました。
【まとめ】勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ
勤怠管理システムを選ぶには、各サービス・製品の特徴を把握し、自社の目的やニーズに合った会社を見つけることが大切です。
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