ワークフロー機能付きの勤怠管理システムおすすめ10選【2025年最新】

目次
• ワークフロー機能付きの勤怠管理システムがおすすめの理由
• 【比較表】ワークフロー機能付きの勤怠管理システム
• ワークフロー機能付きの勤怠管理システムおすすめ10選
• 勤怠管理システムの選び方
• まとめ：勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ

ワークフロー機能付きの勤怠管理システムがおすすめの理由

まずは、ワークフロー機能付きの勤怠管理システムがおすすめの理由を解説します。

勤怠管理システムとは、従業員の出勤時間や労働時間、休暇取得日数といった労働状況を管理できるシステムです。労働状況の管理だけでなく、従業員の出退勤の打刻や記録、残業や休暇の申請、シフト作成、労働時間の集計なども一元管理できます。

ワークフロー機能付きの勤怠管理システムでは、以下のような勤怠申請・承認が可能です。

近年、勤怠申請ワークフローをシステム化する企業が増えています。実際に、jinjer株式会社が2024年1月に小規模企業から大企業を対象に行ったワークフローシステム利用における実態調査の中で、「社内で行われている（システムを使った）ワークフロー申請についてあてはまるものは？」という質問に対し、67.8%が勤怠申請と回答しました。

出典：jinjer株式会社「ワークフローシステム利用における実態調査」

この調査から社内のさまざまなワークフローの中でも、勤怠申請ワークフローのシステム化は会社の規模を問わず多くの企業で進んでいることがわかります。

ワークフロー機能を搭載した勤怠管理システムには、以下のようなメリットがあります。

スマホで勤怠申請・承認できる

ワークフロー機能付きの勤怠管理システムなら、パソコンだけでなくタブレットやスマートフォンでも場所を選ばず勤怠申請・承認が可能です。従業員が申請すると、管理者に通知メールが自動送信される機能も搭載。外勤中や派遣先でも、いつでもどこでも気付いたタイミングで申請・承認できるため、申請漏れや未承認によるワークフローの停滞を防げます。

関連記事：スマホ対応でおすすめの勤怠管理システム

ICカード打刻で交通費精算ができる

勤怠管理システムでは、交通費精算のフローも効率化できるものもあります。交通系ICカードを専用リーダーにかざすと出退勤の打刻に加えて、各交通機関の乗車履歴を自動で読み取り経費として登録可能。交通費申請の手入力で起きがちな申請ミスと差し戻しを防ぎ、経費精算業務のワークフローを効率化できるメリットがあります。

関連記事：交通費精算ができるおすすめ勤怠管理システム

給与計算まで一括でできる

勤怠管理システムと給与計算ソフトを連携させることで、給与計算フローまで効率化できます。勤怠管理システムで集計した有給取得日数や深夜の残業時間などの勤務情報から、給与計算ソフトが自動で給与を計算。システム上でデータを共有できるため、入力ミスや計算ミスを大幅に削減し、業務改善による担当者の残業時間削減も期待できます。

なお、勤怠管理・給与計算システムを連携したいとお考えなら、同じ会社が提供するシステムの連携がおすすめ。「情報連携をスムーズに行える」「統一感のある画面デザインで使いやすい」といったメリットがあります。勤怠管理システムと同じシリーズで給与計算ソフトも提供している会社もあるので、比較選定の際は確認しておきましょう。

関連記事：給与計算まで一括でできるおすすめ勤怠管理システム

勤怠管理システムの導入を検討中の方は、ぜひPRONIアイミツ（当サイト）をご活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った勤怠管理システム（最大6社）をご案内可能です。1社1社に問い合わせる手間・ツール選びの時間を大幅に節約できるため、ぜひ一度以下のボタンからお試しください。

【比較表】ワークフロー機能付きの勤怠管理システム

ここからはワークフロー機能付きの勤怠管理システムを比較します。初期費用、月額料金、無料トライアル期間を比較した以下の表をご覧ください。

おすすめの勤怠管理システムでは、どのサービスでも無料トライアル期間が用意されているため、本格導入前にワークフロー機能が試せます。事前に申請・承認の操作や画面の見やすさを体感したい方におすすめです。

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ワークフロー機能付きの勤怠管理システムおすすめ10選

ここからは、ワークフロー機能付きの勤怠管理システムのなかでも特におすすめの10選を紹介していきます。勤怠管理システムの導入を検討している場合はぜひ参考にしてください。

勤怠管理システムの選び方

勤怠管理システムを選ぶ際には、以下のポイントを押さえておきましょう。

まずチェックしたいのは、自社の従業員のITリテラシーに合うシステムかどうか。せっかく導入しても「使い方が分からない」という理由で敬遠されてしまっては意味がありません。無料お試し期間を提供している勤怠管理システムも多いので、積極的に利用して操作性を確認しましょう。

勤怠管理システムは、利用人数・規模によって料金が変動します。価格の安さだけに目を向けるのではなく、自社のニーズに合うプランが提供されているかをチェックしましょう。

勤怠管理システムは、全従業員がほとんど毎日利用する重要なツール。スムーズに運用できるよう、万が一のトラブルの際のサポート窓口の有無などを確認するとよいでしょう。

より詳しい選び方については、別記事「勤怠管理システムの選び方、比較方法」で解説しています。2025年最新のおすすめ勤怠管理ソフトも紹介していますので合わせてご覧ください。

まとめ：勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ

勤怠管理システムを選ぶには、各サービス・製品の特徴を把握し、自社の目的やニーズに合った会社を見つけることが大切です。PRONIアイミツでは、機能やセキュリティ体制、指定の連携ツールや無料プランの有無など、あなたの会社に最適なサービスを、機能一つから探すことができます。
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とはいえ、数ある勤怠管理システムを比較して自社のニーズに合ったものを選ぶのは大変です。「まず候補を絞りたい」という担当者はぜひPRONIアイミツを活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った勤怠管理システムが分かる診断（無料）ができます。