36協定でおすすめの勤怠管理システム10選【2025年最新版】
従業員の情報が複数のシステムに管理しているので、一括管理したいとお考えの方も多いのではないでしょうか?
そこでおすすめなのが、労務管理システムと連携が出来るおすすめの勤怠管理システムを導入することです。労務管理システムと連携すれば双方の情報を共有ができるようになるので、業務効率化を図ることができます。
この記事では、営業・バックオフィス・情報システムなど、さまざまな分野の法人向けSaaSサービスを比較検討できる「PRONIアイミツ」が、労務管理システムと連携が可能なおすすめの勤怠管理システムを厳選してご紹介!労務管理システムと連携のメリットや勤怠管理システムの選び方も詳しく解説していきます。
- 1.36協定とは
- 2.36協定に対応している勤怠管理システムのメリット
- 3.勤怠管理システム(ソフト)の選び方
- 4.36協定に対応しているおすすめの勤怠管理システム10選
- 5.【まとめ】勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ

1.36協定とは
36協定は、時間外、あるいは休日における労働に関する規定をまとめた協定です。労働基準法第36条に基づき、会社は法定労働時間である週40時間、1日8時間の労働を超える時間外労働や休日労働を命じる場合、書面による協定を結び労働基準監督署へ届け出を行わなければなりません。
これまでは労使間の合意があれば、労働時間を無制限に延長することも可能でした。そのため、36協定が形骸化しているケースもあったと言えます。しかし、近年の法改正によって、時間外労働の上限時間は法的に定められることとなりました。
今日では労働時間をより厳しく管理することが求められており、違反した企業への罰則規定も存在します。36協定に基づいて正確な勤怠管理を実施するには、適切なシステムの導入が必要となるでしょう。
2.36協定に対応している勤怠管理システムのメリット
36協定に対応している勤怠管理システムを導入することで、勤怠管理における業務効率化を実現できます。
たとえば、勤怠管理システムを活用して残業を申請すれば、管理者は適切な労働時間を把握することが可能です。勤怠管理をシステムで一本化することにより、残業を申請した人物が時間を超過しているようであれば、協定違反とならないよう管理者は申請を却下できます。
その分、時間に余裕のある従業員へ業務を配分できるため、社員間の業務量に極端な差が出てしまうような事態を防ぐことも可能です。働きやすい職場を実現することで、社員の定着率も上がるでしょう。
また、労働時間が超過しそうな場合は事前にアラートで各従業員へ通知されるため、いきなり残業ができなくなってしまう状況も回避できます。
3.勤怠管理システム(ソフト)の選び方
勤怠管理システムを選ぶ際には、以下のポイントを押さえておきましょう。
・操作性
まずチェックしたいのは、自社の従業員のITリテラシーに合うシステムかどうか。せっかく導入しても「使い方が分からない」という理由で敬遠されてしまっては意味がありません。無料お試し期間を提供している勤怠管理システムも多いので、積極的に利用して操作性を確認しましょう。
・料金プラン
勤怠管理システムは、利用人数・規模によって料金が変動します。価格の安さだけに目を向けるのではなく、自社のニーズに合うプランが提供されているかをチェックしましょう。
・サポート体制
勤怠管理システムは、全従業員がほとんど毎日利用する重要なツール。スムーズに運用できるよう、万が一のトラブルの際のサポート窓口の有無などを確認するとよいでしょう。
4.36協定に対応しているおすすめの勤怠管理システム10選
ここでは36協定の遵守に役立つ勤怠管理システムをご紹介します。残業時間の超過に悩まされている場合や、従業員への業務配分に課題を抱えているケースで活用したいサービスです。
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料金
月300円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
KING OF TIMEは、正規雇用の従業員の出退勤管理はもちろんのこと、アルバイトのシフト管理にも役立てられる、多様な働き方に対応可能な勤怠管理システムです。デスクトップからの打刻はもちろん、スマートフォンからも打刻を行えるため、リモートワークの導入にも役立つでしょう。リアルタイム集計で勤務時間や打刻時間を収集することで、残業時間の管理を行えます。給与管理システムなど、その他のサービスとの連携にも活用できるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
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従業員1人1人個々の残業時間、遅刻、早退、欠勤等々細部にわたって所要時間を監視でき、過払い等を減らせ、経費の節約に重宝している。
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コンプライアンスの強化、従業員の残業時間や休暇特殊常用などの管理は経営面でも重要なので人事の膨大な集計作業を減らすことができた。
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料金
月200円/ユーザー -
初期費用
なし
-
最低利用期間
なし
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最低利用人数
なし
ジョブカン勤怠管理は、勤怠管理システムのなかでもポピュラーなサービスで、豊富な機能と使いやすさに特徴があります。出勤管理やシフト管理はもちろん、休暇申請もシステム上から行えるため、従業員の情報管理を一元化できる点が大きな強みです。これらの申請内容や打刻状況を統合し、36協定に違反していないかどうかをひと目でチェックできるため、従業員の増加で残業管理が疎かになっている職場の改善にも効果的でしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
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スマホで打刻できる。各種申請がやり易い。打刻修正が簡単である。給料明細がプリントアウトできる。画面が見やすい。
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画面が直感的で、説明書がなくても使えるところがいいです。以前の勤怠管理システムは申請システムなど煩雑でしたが、今のシステムは申請も楽で良いです。

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料金
月200円/ユーザー -
初期費用
なし
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
AKASHIは定期的に行われる法改正や、複雑化した就業ルールに対応するために誕生した勤怠管理システムです。クラウド型で運用できるため、Web打刻やスマホ打刻など、豊富なアプローチで勤怠管理を実施できます。テレワークを実施している従業員の進捗管理をシステム上で行うことも可能。36協定設定にも対応しており、違反していないどうかを簡単に把握できます。働き方が変わっても適切な従業員のマネジメントを実現できるシステムです。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
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今までタイムカード管理だったのが、ネットで打刻できるようになり、テレワークでも不便なく管理できるようになりました。
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自社でカスタムできる範囲が広いので便利。サポートも迅速で適切。費用も利用人数×単価で清算されるのでリーズナブル。

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料金
月3,980円 -
初期費用
なし
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
マネーフォワードクラウド勤怠は、直感的な操作性に優れた勤怠管理システムです。通常の勤怠管理機能はもちろん、休暇管理機能も利用できるため、従業員の労働時間だけでなく、有休消化率もリアルタイムで把握できます。適切な残業時間を各従業員に順守させることで、36協定に反しない、多様な働き方の実現をサポートすることが可能です。異動によって雇用形態に変化があった場合でも、異動履歴に基づいて勤務データを出力できる点が強みだと言えるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 申請のモバイルデバイス対応
- シフトの作成機能
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GUIが他に比べて分かり易く直感的である事。例えば、入力する場合は日時毎に入力できる。また管理者として休日や勤務体系の設定を複数用意でき集計時に大幅な工数削減ができた。
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労働者個人の詳細の勤務態度等が即座に分かるので非常に安心が出来る。信頼出来るシステム。いちから操作方法を学ばなくても誰でも使用しやすい。万全なセキュリティで何があっても現場まで急行してくれるアフターサービスも気に入っている。

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料金
月400円/ユーザー -
初期費用
なし
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最低利用期間
12ヶ月
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最低利用人数
10人
jinjer 勤怠は、社員数の少ない中小企業から名だたる大企業にいたるまで、豊富な導入事例があり、幅広いスケールに対応可能な勤怠管理システムです。テレワークを導入している企業や、営業などの外出が多い従業員でも使いやすいスマホ打刻機能を完備。多様な働き方に対応しています。さらに、勤怠データを自動で集計するため、リアルタイムで勤務状況を確認可能。36協定の順守を促進します。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
-
今迄は電話で勤怠管理していたが、その手間が無くなった。 振替休日の管理がし易くて、残りの日数が直ぐに分かる。
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反応がいいです。シフト制なので日勤なのか夜勤なのか午後勤務なのかボタンがあって勤怠管理がしやすいと思います。

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料金
月100円/ユーザー -
初期費用
0円
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最低利用期間
なし
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最低利用人数
1人
ハーモス勤怠(HRMOS勤怠)は人事実務のプロフェッショナルが組織的に開発した、無料で利用できる勤怠管理システムです。無料でありながらも優れた機能を搭載している点が特徴。
1,000社以上のサポート経験から培ったノウハウを反映した打刻システムや、出退勤データCSV出力機能などを使いやすく提供しています。有料版ではさらなる機能拡張も実現できるため、まずは勤怠管理システムを体験してみたい、という方にもおすすめです。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- チャットサポートあり
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操作が簡単で、おじさんにも使いやすい。特段、使い方の説明書がなくても、十分使いこなせる。申請し忘れたときの、催促のメールがうるさいし、煩わしい。
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無料で利用できるところが最大の良い点です。一般の利用者が使用する打刻画面はシンプルでわかりやすい。簡単な集計機能もありライトユーザーにはおすすめです。

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料金
お問い合わせ -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
勤次郎Enterpriseシリーズは、勤怠管理システムだけでなく、人事管理や健康管理にも活用できるシステムを包括的に提供しているサービスです。日々多様化する雇用体系や賃金システム、そして36協定に関連する法改正にキャッチアップできる仕組みを備えています。複数の打刻方法を利用できるだけでなく、複雑な勤怠情報を自動化することも可能。また、アラート通知によって残業時間の超過を防ぐことができます。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
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いつでも何処でも入力でき、残業や勤務変更などが自由に入力できる。上長の承認もわかりやすくて確認が楽である。
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スマートフォンでも打刻ができる。部下の管理状況を確認しやすい。承認しやすい。操作しやすい。前月の勤務状況を簡単に確認できる。
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料金
月2,200円 -
初期費用
なし
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最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
スマレジ・タイムカードは、0円から利用できるクラウド型の勤怠管理システムです。タイムレコーダーを使用せず、デスクトップPCやスマホから打刻できるため、柔軟な働き方を実現できます。また、タグを利用した日報管理機能や、予算消化率を管理できる仕組みまで、豊富な機能を搭載。効率的な働き方をサポートします。もちろん、36協定にも対応。テレワークや働き改革にぴったりなシステムだと言えるでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- チャットサポートあり
- メールサポートあり
- 電話サポートあり
- 申請のモバイルデバイス対応
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導入前より従業員の勤怠管理がしやすくなった。 労務管理や労働時間の把握がしやすくなり、労務環境改善に役立っている。 ただ打刻漏れなどの修正が少し手間がかかる。
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勤務時間の把握が就業者、管理者側も分かりやすく、扱いも説明しやすく、 取り扱いの部分で評価が高いです。勤怠管理システムの領域ではありますが、労務管理システムの模範であると思います。 仕事全般において、安全に配慮しているというアピールができます。

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料金
月300円/ユーザー -
初期費用
0円
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
タイムカードを必要としないタイムレコーダーを導入できるのが、タッチオンタイムです。生体認証を採用したタイムレコーダーや、Webブラウザから利用できるタイムレコーダーなど、豊富な種類のレコーダーが用意されています。打刻だけでなく、申請の承認や休暇管理の効率化も実現可能。複雑な就業ルールやテレワークにも対応しているため、働き方改革の推進、36協定の順守にも効果的なサービスです。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- メールサポートあり
-
使用方法が非常に分かりやすく、勤怠管理が明確でスムーズとなっているおかげで、円滑な業務ができているため。
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画面がとても見やすく、誰でも簡単に利用ができる点が優れていると思う。また、不明点があってもヘルプ画面を見れば大抵のことは解決するため、操作において手間を取ることはほとんどないところも良い点だと考える。

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料金
月100円/ユーザー -
初期費用
0円
-
最低利用期間
なし
-
最低利用人数
なし
ユーザビリティを第一に考えて誕生したのが、レコルという勤怠管理システムです。勤怠管理システムの導入がはじめてであっても、使い方に迷わない設計に魅力があります。休暇管理や勤怠集計などの必要な機能が誰でもすぐに扱えるため、教育コストの節約にもつながるでしょう。もちろん、SmartHRのような人事労務ソフトや、マネーフォワードクラウド給与システムとの連携も可能です。効率的に勤怠を管理したい方にはうってつけでしょう。
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
- 変形労働時間制への対応
- 36協定対応のアラート機能
- 打刻漏れアラート設定
- メールサポートあり
-
作業員の出社状況、協議場所、協議時間が鮮明にわかることが良いポイントである。 また、残業時間の把握や会社全体の就業時間がわかることも良いポイントである。
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一覧で確認でき、入力漏れの把握がすぐ出来るトータルの時間数の把握が簡単 時間外の時間数も簡単に確認出来る点は便利だと思う
5.【まとめ】勤怠管理システム選びで迷ったらPRONIアイミツへ
勤怠管理システムを選ぶには、各サービス・製品の特徴を把握し、自社の目的やニーズに合った会社を見つけることが大切です。
PRONIアイミツでは、機能やセキュリティ体制、指定の連携ツールや無料プランの有無など、あなたの会社に最適なサービスを、機能一つから探すことができます。
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