クラウド給与計算システムを比較・おすすめのポイントも解説【2025年最新】

目次
• クラウド給与計算システムとは
• クラウド給与計算システムの導入メリット
• クラウド給与計算システムの比較ポイント
• 機能や料金でクラウド給与計算システムを比較
• 【2025年最新】クラウド給与計算システムおすすめ10選
• まとめ：クラウド給与計算ソフトは、機能・費用のトータル比較がおすすめ

クラウド給与計算システムとは

クラウド給与計算システム（クラウド給与計算ソフト）とは、給与や賞与、各種手当の計算を自動化することで業務効率化を図れるシステムです。社会保険料や控除、税金などの複雑な計算も自動化し、人事労務担当者の毎月の業務負担を大きく削減できます。  

さらに、勤怠管理システムと給与計算システムを連携すると、従業員の勤怠データを給与計算システムに自動入力でき、入力の手間と転記ミスを防げます。

給与計算システムは、導入形態によってクラウド型・インストール型(パッケージ型)・オンプレミス型の3種類に分けることができます。3種類の給与計算システムを比較した表をご覧ください。

クラウド給与計算システムは、ブラウザ上でアカウントにログインすることで利用可能。初期費用は無料か低価格で、選択したプランに応じて月額料金を支払います。利用料金はユーザー数によって変わりますが、1ユーザー数百円と安い料金で利用できます。

ツールのアップデートはサービス提供会社によって自動で行われるため、法改正や税率変更があっても常に最新版を使える点もおすすめポイントです。

インストール型の給与計算システムは、パッケージ製品を購入し、パソコンにソフトをインストールして使う給与計算システムです。買い切り型なのでランニングコストがかからない点がクラウド型と比較したメリットとなっています。

また、インストール型の給与計算システムはインターネット環境が不要でオフラインでの作業が可能です。ただし、インストールしたパソコンでしか利用できない点・法改正のたびに手動でバージョンアップする必要がある点にはご注意ください。→インストール型の給与計算システムのおすすめ紹介（別記事）

オンプレミス型の給与計算システムは、自社サーバーにシステムを構築して管理・運用する給与計算システム。カスタマイズ性が高く、自社の細かいニーズに合わせたシステムを構築できる点がメリットです。ランニングコストはかかりませんが、導入費用が非常に高く、技術者による定期的なメンテナンスが必要となるため、大企業向けといえます。

クラウド給与計算システムの導入メリット

クラウド給与計算システム（クラウド給与計算ソフト）の導入メリットを6つ紹介します。

給与計算システムを導入すると、毎月の給与計算業務を自動化できるだけでなく、社会保険料や税金、各種手当などの計算も自動化できます。銀行振込まで行える給与計算システムなら、給与計算業務をオンライン上で全て完結させることも可能。給与計算業務にかかる手間と時間を大幅に削減できる点がメリットです。

人事労務担当者が給与計算業務にかけていた時間を他の業務に充てることができ、業務効率の向上や人手不足の解消につながります。

手入力で給与計算する場合、ヒューマンエラー・入力ミスが起こる可能性があります。とくに、締め日から給与支給日までの期間が短い企業では、時間に余裕がなく、人為的ミスが起こりやすくなります。

給与計算システムでは、勤怠管理システムと連携して勤怠データの自動集計・自動入力が可能です。連携機能を使えば、従業員の勤怠データを1つひとつ入力する手間と転記ミスを削減できる点がメリットです。

給与計算担当者は、頻繁に行われる法令改正や税率変更の度に新しい知識を取り入れなければなりません。古い知識や間違った方法で計算してしまうと、コンプライアンス違反になる恐れがあります。

クラウド給与計算システムには無料の自動アップデート機能があり、法改正や税率変更にも即座に対応可能。面倒な更新作業を自社で行う必要がなく、常に最新の計算方法で給与計算できる点がメリットです。

クラウド給与計算システムは、インターネットに接続ができる環境下であれば、デバイス（パソコン・スマホ・タブレット）や場所を選ばずアクセスできます。いつでもどこでも給与計算業務や給与明細の確認ができ、リモートワーク・テレワークの促進にも役立ちます。オフィスに制約されることなく業務ができるため、通勤時間や交通費の削減につながる点もメリットです。

スマホ専用のアプリを提供している給与計算システムもあり、いちいちブラウザを開かなくても作業を進められます。→おすすめの給与計算アプリ（iPhone・Android対応）

クラウド給与計算システムでは、Web給与明細を発行可能。従業員は給与明細をWebで確認できるため、用紙代・封筒代・郵送代などのコストを削減できます。印刷時のインク代、印刷機材のメンテナンス費などの費用の節約にも繋がります。

勤怠管理システムと連携すれば、紙のタイムカード代も不要になります。さらに、紙で保管していた書類をデジタル化することでファイリングの手間や紛失の心配もなくなります。ペーパーレス化によるコスト削減を実現したい企業には給与計算システム・勤怠管理システムの検討がおすすめです。

給与計算システムは、他のシステムとの連携でバックオフィス全体の業務効率化を実現できる点もメリット。たとえば、人事データベースと給与計算システムを連携することで、雇用形態が違う社員1人ひとりの給与計算をスムーズに行うことができます。そのほか、勤怠管理システム・社会保険ソフト・人事労務管理システムとの連携も便利でおすすめです。

下記の経済産業省の調査では、デジタル化の取組により多くの企業が「働き方改革に貢献した」「取引先との連携強化につながった」と副次的な効果を実感していることがわかっています。クラウド給与計算システムの導入によりこれらのメリットを感じられる場合もあるでしょう。

引用：経済産業省中小企業庁「小規模事業者におけるデジタル化とデータ利活用」

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クラウド給与計算システムの比較ポイント

企業に導入するクラウド給与計算システム（クラウド給与計算ソフト）を選ぶ際、比較ポイントは次の5つです。

正社員やアルバイト以外にも、フレックス制や裁量労働制を採用している企業では、給与計算方法が複雑です。クラウド給与計算システムによって対応可能な給与形態は違うため「自社の雇用形態に対応した給与計算ができるか」という観点で比較することがポイントです。

クラウド給与計算システムでは、他システムと連携してバックオフィス業務全体の効率化を図ることが可能ですが、給与計算システムによって連携できる外部サービスに違いがあります。そのため「自社システムとの連携が可能か」という観点で比較することがポイント。

また、クラウド給与計算システムと一緒に、同じシリーズのクラウドサービスを導入することもおすすめ。スムーズなデータ連携を実現できます。

クラウド給与計算システムはインターネット上にデータを保管する仕組みで、ハッキング・サイバー攻撃による不正アクセスのセキュリティリスクが伴います。「クラウド給与計算システムの提供会社が信頼できるか」「万全のセキュリティ対策を行なっているか」という観点での比較も重要。堅牢なセキュリティが強みのクラウド給与計算システムもあります。

クラウド給与計算システムは月額課金制（サブスクリプションモデル）となっており、ユーザー1人あたりの月額料金が決まっているサービスが一般的です。通常、ユーザー数や追加機能（オプション）が増えるほど月額料金は高くなります。システム導入に充てられる予算や必要機能を踏まえて、費用対効果の高いクラウド給与計算システムを選びましょう。

クラウド給与計算システムの基本機能は同じですが、各社サービスを比較すると操作方法が違います。UI（ユーザーインターフェース）が分かりにくいと、実務で操作に慣れるまで時間がかかることも。無料トライアル期間中に使いやすさ・操作性を確認し、導入するクラウド給与計算システムを選ぶのもおすすめです。

機能や料金でクラウド給与計算システムを比較

ここからは、クラウド給与計算システム（クラウド型給与計算ソフト）の機能・料金・特徴を比較します。自社の予算や必要な機能と照らし合わせながら、おすすめのクラウド給与計算システムをご確認ください。

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【2025年最新】クラウド給与計算システムおすすめ10選

2025年最新比較でおすすめのクラウド給与計算システム10選を紹介します。

まとめ：クラウド給与計算ソフトは、機能・費用のトータル比較がおすすめ

クラウド給与計算システムは、インストール型やオンプレミス型のシステムと比較して自動アップデートされる点が特徴で、法改正や税率変更があっても常に最新版を使えるというメリットがあります。ミスなく確実に給与計算を行いたい企業にクラウド給与計算システムはおすすめです。

とはいえ、数あるサービスから最適なものを選定するのは大変です。PRONIアイミツ（当サイト）では、いくつかの質問に答えるだけで条件に合ったクラウド給与計算システムが分かる診断を用意しています。BtoB受発注支援のプロであるコンシェルジュが要望やお悩みをヒアリングした上でクラウド給与計算システムを比較選定することも可能ですので、ぜひ一度お試しください。