勤怠管理システムおすすめ10選！PRONIアイミツが徹底比較

目次
• 【独自アンケート調査】シェアが高い人気の勤怠管理システム
• 勤怠管理システムの選び方・比較ポイント
• PRONIアイミツ厳選おすすめ勤怠管理システム比較表
• PRONIアイミツ厳選おすすめの勤怠管理システム10選
• 勤怠管理システムとは
• タイムカードと比較した勤怠管理システムのメリット
• まとめ：勤怠管理システム選びに迷ったらPRONIアイミツへ
• よくある質問

【独自アンケート調査】シェアが高い人気の勤怠管理システム

PRONIアイミツSaaS（当社）は、勤怠管理システムを導入・利用している担当者1,000名を対象に独自アンケート調査を実施しました。調査の結果、利用率が最も高かったのは「ジョブカン勤怠管理」で、全体の17.9%（179名）を占める結果となりました。

【利用が多い勤怠管理システム上位】

次いで、マネーフォワードクラウド勤怠は10.7％、楽々勤怠が10.0％、KING OF TIMEが8.9％と続きました。勤怠管理システムのシェアはかなり分散しており、その他にかなり多数のツールが含まれています。中小企業（従業員数300人以下）や大規模企業（従業員数1,000人以上）ごとに結果が若干異なりました。

独自アンケート調査では、勤怠管理システムを乗り換えで利用しているユーザーに「乗り換え理由」についても質問しました。一番回答が多かった理由は「機能が不足していた（27.7％）」で、次いで「自社の働き方に合わなくなった（24.9％）」が続きました。

選ぶ際は価格を重視するユーザーが多いためか、乗り換えでは「コストの高さ（18.9％）」を不満に考えるユーザーは、それほど多くない様子でした。このことから、勤怠管理システムを選ぶには、『自社の働き方に合っているか』という視点が重要であることが分かります。

勤怠管理システムの選び方・比較ポイント

勤怠管理システムは数が多く、「選ぶのが難しい」「候補を絞るのも一苦労」と感じる担当者もいるでしょう。ここでは、PRONIアイミツSaaS（当社）で2025年5月～9月にかけて、勤怠管理システムを問い合わせたユーザーデータを参照しながら、比較のポイントを解説します。

PRONIアイミツの「勤怠管理システムランキング」では、さまざまな条件で最新の勤怠管理システムを比較できます。条件を絞り込んで探したい方はご参照ください。  

勤怠管理システムを選ぶ際は、自社にとって使いやすい打刻方法に対応しているかが重要です。勤怠管理システムの打刻方法としては、下記の方法があります。

業種別の導入したい打刻方法「モバイル打刻」「PC・Web打刻」が人気

PRONIアイミツSaaS（当社）で、勤怠管理システムを問い合わせたユーザーデータを見ていきます。導入したい打刻方法を尋ねたところ、モバイル打刻とPC・Web打刻が人気でした。ただ業種によって、若干傾向が異なります。

現場勤怠が中心の建設・工事業では、モバイル打刻を希望する割合が最も高くなりました。場所を問わず打刻が必要な働き方をする場合、需要が高いようです。また、製造業やサービス業では、静脈認証を希望する割合が他業種と比べ、わずかに高くなっています。誰がどこで出入したかが重要になるため、生体認証打刻の需要がややあるようです。

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自社の働き方に対応していないシステムを導入してしまうと、効率的な勤怠管理が行えなくなってしまいます。PRONIアイミツSaaS（当社）で勤怠管理システムを問い合わせたユーザーの勤務形態を見ると、固定時間制が多いものの、変形労働時間制が45.8％、フレックスタイム制も8.3％と、さまざまな勤務形態を取っていることが伺えました。

勤怠管理システムによっては対応していない勤務形態もあるため、自社の勤務形態に対応したツールを選ぶことが大切です。将来的にフレックスタイム制を導入する予定かなども考え、予め対応しているツールを選んでおくと安心でしょう。

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勤怠管理システムは、ほかの業務システムと連携可能ですが、連携できるシステムの種類は製品によって異なります。したがって、「既存システムと連携できるか」を確かめてから導入する必要があります。

勤怠管理システムと給与計算ソフトを連携することで、従業員の労働時間の集計から給与の計算までを自動化でき、勤怠管理業務だけではなくバックオフィス業務の全体の効率化が実現します。すでに給与計算ソフトを使っている企業では、そのソフトと連携できる勤怠管理システムを探しましょう。

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「使いやすい勤怠管理システムか」という観点は、システムを選ぶうえでとても大切なポイントです。打刻画面に遷移するのに時間がかかったり、操作をするのが難しかったりするシステムは、従業員に「使いにくい」と思われてしまいます。

せっかくお金をかけて勤怠管理システムを導入しても、なかなか社内に浸透していかなければ、いつまで経っても効率的な勤怠管理が実現しません。無料トライアル期間に従業員に実際にシステムを使ってもらい、「使いやすい」という意見がより多かった勤怠管理システムを選ぶのがおすすめです。

勤怠管理システムを選ぶ際は、費用感の違いをしっかりと把握しておきましょう。導入形態（クラウド型・パッケージ型）によって費用相場やランニングコストの計算が変わってきます。

パッケージ型は買い切り型で、初期費用のみ必要という製品も少なくありません。クラウド型は月額課金制で利用人数ごとに料金がかかる仕組みです。パッケージ型の費用相場は、初期費用が30万〜100万円、ランニングコストは数万円程度の保守費用やサーバー費用などです。クラウド型は、初期費用が3万〜50万円、月額費用は1ユーザーあたり100〜500円程度となっています。

関連記事：勤怠管理システムの費用相場

以上、勤怠管理システムの選び方を解説しました。「まず候補を絞りたい」という担当者はぜひPRONIアイミツを活用ください。PRONIアイミツでは、以下のボタンからいくつかの質問に答えるだけで、希望要件に合った勤怠管理システムが分かる診断（無料）ができます。ぜひ一度お試しください。

PRONIアイミツ厳選おすすめ勤怠管理システム比較表

ここからは実際に、PRONIアイミツが厳選した勤怠管理システムの初期費用・月額料金、導入実績や機能を比較します。以下の比較表をご覧ください。

主要製品の多くは初期費用なしで導入できます。月額料金を比較すると、1ユーザーあたり100円～400円ほどです。「ジョブカン勤怠管理」や「KING OF TIME」などの人気の勤怠管理システムでも、初期費用は無料、月額料金は1ユーザーあたり300円以下の低コストで利用できます。

さらに、多くの製品で無料トライアル期間が設定されています。無料トライアル期間の目安は1ヶ月〜2ヶ月間です。本導入を円滑にするため、トライアル期間中に画面の可読性や操作感を確認しておきましょう。

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PRONIアイミツ厳選おすすめの勤怠管理システム10選

PRONIアイミツが最新比較した、おすすめの勤怠管理システム10製品を紹介します。導入実績や利用しやすい料金体系か、さまざまな勤務形態に対応できるかなどの基準で選出しました。

勤怠管理システムと一口に言っても製品ごとに特徴が違い、企業規模や業務形態、働き方によっても選ぶべき製品は変わります。自社に合ったシステム選びの参考にしてください。

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以上、機能比較や料金比較でおすすめの勤怠管理システムを詳しく解説しました。PRONIアイミツでは、ITツール受発注支援のプロとして、勤怠管理システム選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのツールがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

勤怠管理システムとは

勤怠管理システムとは、従業員の出退勤時間の記録・管理ができるシステムです。出退勤時間の打刻はもちろん、残業や各種休暇の申請、シフト作成、労働時間や残業時間の集計などが一つのシステムで完結できます。

勤怠管理システムは、自社のサーバーや通信回線にインフラを構築するオンプレミス型とオンライン上のサーバーで情報を管理するクラウド型の2種類に分かれます。クラウド型は、インターネット環境とパソコンやスマートフォンなどのデバイスさえあればどこからでも出退勤の打刻や各種申請が可能。テレワークや直行直帰が多い職場では、クラウド型の勤怠管理システムが適しています。

実際に、テレワークなどの多様な働き方に対応するため、多くの企業で勤怠管理システムの導入が進んでいます。2021年に総務省が公表した調査によると、2020年度に勤怠管理ソリューションを導入済みの企業は29.6%（2019年度より1.6ポイント上昇）。Slackなどのコミュニケーションツール、Google Workspaceなどのグループウェア、オンライン会議システム、電子契約システムなどに次いで、勤怠管理システムは企業DXの有効な手段と認識されています。

勤怠管理システムは、どのような機能が使えるかという観点でタイムレコーダー型・多機能型・業務連携型の3種類に分けられます。以下、それぞれの特徴やメリットをご確認ください。

3種類のうち、最もシンプルなのがタイムレコーダー型で、勤怠管理システムのアプリをインストールすることで、スマートフォンやタブレットがタイムカード代わりになるというものです。多機能型は、打刻機能のほか、自動集計機能、アラート機能、シフト管理機能、ワークフロー機能など多彩な機能を搭載した勤怠管理システムです。

業務連携型は、給与計算ソフトや会計ソフトなど、ほかの業務システムを連携可能な勤怠管理システムのことで、バックオフィス全体の業務効率化に役立ちます。自社の業務にどこまでの機能が必要かを確認したうえで、勤怠管理システムを選ぶのがおすすめです。

タイムカードと比較した勤怠管理システムのメリット

タイムカードと比較した時の勤怠管理システムのメリットは、打刻方法が多彩な点にあります。  タイムカードの場合はタイムカードが設置されている会社や事業所でしか打刻できませんが、勤怠管理システムはパソコン・スマートフォン・タブレット・ICカードなどさまざまな打刻方法に対応しており、外出先や自宅などあらゆる場所で打刻可能です。スマートフォンやタブレットのGPS機能を活用した打刻方法や生体認証打刻を用いれば、なりすましや不正打刻を防止することも可能。テレワークや現場仕事など多様な働き方に対応できます。

また、勤怠管理を効率化できる点もシステム化のメリット。タイムカードでの勤怠管理の場合、毎月、従業員の労働時間を担当者が手作業で集計しなければなりませんでした。勤怠管理システムは労働時間を自動集計してくれるため、勤怠管理業務を大幅に効率化できます。

関連記事：勤怠管理システムとは？メリット・デメリットや導入事例を解説

まとめ：勤怠管理システム選びに迷ったらPRONIアイミツへ

勤怠管理システムでは、従業員の勤怠状況をリアルタイムに把握でき、紙やエクセルでの勤怠管理では難しかった月の途中での労働時間や残業時間も即座に把握できるようになります。また、労働時間や残業時間はシステムが自動集計してくれるため、担当者が労働時間をタイムカードからエクセルに転記したり、集計したりといった手間を削減できます。勤怠管理システムの導入により、バックオフィス業務は大幅に効率化するでしょう。

とはいえ、勤怠管理システムは製品数が多いため、「自社に最適なシステムを1つに絞り切れない」という担当者もいるでしょう。迷う場合は複数社から見積を取り、条件を比較しましょう。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った勤怠管理システムが分かる診断を用意しています。ぜひ一度お試しください。

よくある質問

勤怠管理システムの機能は製品によって異なりますが、どの製品にも搭載されている基本機能は打刻機能（出退勤の時間を打刻し、記録しておける機能）です。また、多くの勤怠管理システムに搭載されているのが、労働時間の自動集計機能です。自動集計機能により、労働時間の集計を手作業で行う必要がなくなり業務効率化を図れます。そのほか、次のような機能も搭載されています。

無料で使えるクラウド型の勤怠管理ソフトとしては、「フリーウェイタイムレコーダー」「スマレジ・タイムカード」などがあり、費用をかけずに勤怠管理を行いたい場合におすすめです。ただし、無料の勤怠管理ソフトは、労働時間の自動集計機能がない・利用人数が制限される点がデメリット。無料の勤怠管理ソフトの利用上限人数は10人程となっており、従業員数が多い企業には有料版の勤怠管理ソフトがおすすめです。
→無料で使える勤怠管理システムを紹介する記事はこちら

中小企業におすすめなのは、ランニングコストが安い勤怠管理ソフトです。たとえば「ジョブカン勤怠管理」「AKASHI（アカシ）」「freee人事労務」は1ユーザーあたりの利用料金が他社と比較して安いためおすすめです。

多くの従業員を管理し、複雑な就業形態に対応する必要のある大企業の場合、コストよりも機能を重視して勤怠管理システムを選ぶ必要があります。しかし、大企業ほど勤怠管理が複雑ではない中小企業は、機能面よりもコストの安さを重視して勤怠管理ソフトを選ぶのがおすすめです。
→中小企業向け勤怠管理システムのおすすめ解説はこちら