決済代行サービスを徹底比較！最新のおすすめ10選

目次
• 決済代行サービスの比較選定ポイント
• 決済代行サービスの比較表
• 【2025年最新】決済代行サービスおすすめ10選
• 決済代行サービスを導入するメリット
• 決済代行サービスのデメリット・注意点
• まとめ：決済代行サービスを導入して、機会損失を防ごう
• よくある質問

決済代行サービスの比較選定ポイント

決済代行サービスとは、クレジットカード決済やコンビニ決済、口座振替など複数の決済手段を一括導入できるサービスです。店舗やECサイトの運営者は、さまざまなオンライン決済手段を用意することで販売機会の損失を防ぎ、自社の売り上げアップを図れます。

決済代行サービスをお探しの方に向け、まずは決済代行サービスの比較選定ポイントを解説します。

決済代行サービスの利用には初期費用・月額料金・決済手数料がかかります。

決済手数料は商品やサービスが売れるたびにかかるコストで、決済手段ごとに異なります。たとえば、クレジットカード決済では売上金額の約3％、コンビニ決済では1回の決済ごとに数百円の決済手数料がかかります。決済代行サービスを選ぶ際には、各社を相見積もりで比較するのがおすすめです。

なお、決済代行会社の手数料については「決済代行会社の手数料相場」で詳しくまとめているのでぜひご覧ください。

対応する決済手段は、決済代行サービスごとに違いがあります。事前に自社の顧客がどのような決済方法を求めているかを調査し、客層に合った決済方法を提供できる決済代行サービスを導入しましょう。

クレジットカード決済は多くの消費者が利用しており、需要の高い決済手段です。実際に総務省の通信利用動向調査によると、消費者のオンライン決済における支払い方法はクレジットカード払いが約8割を占めています。少しでも販売機会を逃したくない事業者は、クレジットカード決済に対応している決済代行サービスがおすすめです。

PRONIアイミツSaaS（当社）の調査においても、クレジットカードを導入したいと考える事業者が一番多い結果に。電子マネーやQRコードのニーズも高く、クレジットカードを持たない層へのアプローチとして最適です。

決済代行会社によってサポート窓口の受付時間や受付方法はさまざまです。トラブルや不具合が発生した際、すぐに相談できる窓口があるか確認しましょう。特に、入金トラブルや不正利用などの金銭に関わる問題は顧客（消費者）に大きな精神的負担をかけるため、迅速で丁寧な対応が求められます。充実したサポート体制がある決済代行サービスを選びましょう。

オンライン決済では個人情報を扱うため、不正アクセスや情報漏えいなどのセキュリティリスクが発生します。総務省の調査によると、インターネット利用における不安として、最も多かったのが「個人情報やインターネット利用履歴の漏えい」でした。

個人情報が漏えいしてしまうと会社の信用は大きく損なわれます。決済時にはクレジットカード情報を含む顧客の個人情報を取り扱うため、セキュリティ体制が万全な決済代行サービスを利用することが重要です。不正利用や情報漏えいリスクに対し、どのような対策を実施しているのか確認しておきましょう。

公的機関の認証マークを表示しているサービスは、高いレベルのセキュリティ基準を満たしています。各セキュリティ基準の詳細は以下の表を参考にしてください。

決済代行サービスの比較表

ここからは実際に、主要な決済代行サービスを比較しておすすめのサービスを紹介します。以下、コスト（初期費用・月額料金・決済手数料）を比較した表をご覧ください。

料金を公開している決済代行サービスを比較すると、「ペイゲート」は月額料金が1台あたり330円、「イプシロン」「ゼウス」は月額料金が3,000円～と安い料金で利用できます。「イプシロン」「ゼウス」「atone」「アルファノート」は初期費用無料で導入できるため、導入コストをかけたくない事業者におすすめの決済代行サービスです。

数ある決済代行サービスを比較して自社のニーズに合ったものを選ぶのは大変です。「まず候補を絞りたい」という担当者はぜひPRONIアイミツを活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った決済代行サービスが分かる診断（無料）ができます。

【2025年最新】決済代行サービスおすすめ10選

2025年現在、料金や機能を比較しておすすめの決済代行サービス10選を紹介します。各サービスの特徴や、他社と比較したおすすめポイントを紹介しますのでぜひ参考にしてください。

以上、機能比較や料金比較でおすすめの決済代行サービスを詳しく解説しました。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、決済代行サービス選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのサービスがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

決済代行サービスを導入するメリット

店舗やECサイト運営者が、決済代行サービスを導入するメリット3つを紹介します。

第一のメリットは「決済手段不足による顧客の購買機会損失を防げる」ことです。SBペイメントの調査によると、ネットショップでよく利用する支払い手段がない場合、60％以上の顧客が他店舗で商品を購入するという結果となっています。決済手段不足は販売機会を損失する大きな要因になります。

決済代行サービスを導入すればさまざまな支払い方法に対応できるため、決済手段不足による離脱を防止できます。さらに、”他店”から決済手段不足を理由に流出した顧客が、自社で購入する機会にも繋がります。

なお、自社サイトに決済ページがない場合はメールリンク決済がおすすめです。メールリンク決済では、メールに添付したリンクをユーザーがクリックすることで、決済代行会社の決済ページに遷移。ユーザーはオンライン上で決済できます。決済ページを構築する時間とコストをかけずに決済代行サービスを導入できます。

2つ目のメリットは「クレジットカード各社の審査の手間が省ける」ことです。VISAやMastercardなど、複数のクレジットカード会社と直接契約する場合、クレジットカード各社に提出する書類を複数準備しなければなりません。審査基準や書類は会社によって違うため手間と時間を要します。小規模事業者や個人事業主にとって、人手が少ない中でこれらの審査に対応するのは大きな負担でしょう。

決済代行サービスを利用すると、決済代行会社の審査のみでクレジットカードを利用できるようになります。複数の書類を準備する必要はなく、時間と手間を省けるメリットがあります。

月謝などの継続的な支払いにおいて、コンビニや銀行振込は、払い忘れや払込票の紛失が生じる懸念があります。決済代行サービスはクレジットカード・口座振替による自動引き落としにも対応しており、未払いを防止できます。

顧客（消費者）にとっては、払い忘れでサービス利用を停止になるリスクがなくなり安心です。店舗にとっては、売り上げを漏れなく回収でき、スムーズな資金繰りが可能です。このように、口座振替は顧客と店舗の双方にメリットがあります。

決済代行サービスのデメリット・注意点

決済代行サービスはメリットが多い反面、デメリットもあります。決済代行サービスを導入する際は以下の点にご注意ください。

決済代行サービスは月額費用・決済手数料などのランニングコストがかかります。クレジットカード決済代行サービスを利用する場合、売上金額の約3％をクレジットカード決済手数料として支払わなければなりません。加えて、オンラインで決済処理するためのトランザクション費用がかかるサービスもあります。決済手数料は各社のプランや業種、決済手段によって異なるため、事前に把握しておきましょう。

なお、少しでも費用を抑えたい方に向けて「初期費用無料の決済代行サービス」をまとめています。格安の決済代行サービスも紹介しているのでぜひご覧ください。

クレジットカード決済は、顧客（消費者）が決済してから店舗に入金するまでにタイムラグがあります。月末締めの翌月10日払い、20日締めの翌月末払いなど、代金の入金サイクルは決済代行サービスによってさまざま。とりわけ開業したての場合、資金繰りに大きな影響をもたらします。取引先への支払いの前に入金されるように設定できれば、資金繰りに困るリスクを抑えられます。

まとめ：決済代行サービスを導入して、機会損失を防ごう

本記事では、決済代行サービスのおすすめ10選を紹介しました。決済代行サービスを導入することで顧客の決済ニーズを満たし、購買機会の損失を防ぐことができます。売上アップを図りたい店舗・ECサイトはぜひ決済代行サービスを検討ください。

PRONIアイミツでは、さまざまな条件で決済代行サービスを比較できます。導入実績のある業界・企業規模・使いたい機能などで絞り込み、あなたの会社に最適なサービスを探してみてください。→決済代行サービスのランキングはこちら

とはいえ、決済代行サービスは多数あり、どれを導入すべきか迷ってしまうでしょう。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、決済代行サービス選びについての相談を受け付けています。いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った決済代行サービスが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。

よくある質問

決済代行サービスについて、よくある質問に答えます。

決済代行サービスとは、クレジットカード決済やコンビニ決済、口座振替など複数の決済手段を一括導入できるサービスです。決済手段を導入する際の契約手続き・審査も代行してくれるため、複数の決済会社との契約が一括で完了し、手間や時間をかけずキャッシュレス決済を導入できます。

大手の決済代行サービスとしては、「SBペイメントサービス」「GMOペイメントゲートウェイ」「イプシロン」などがあります。大手の特徴は、カード決済だけでなくQRコード、海外決済サービスなど数多くの決済手段が揃っていること。顧客のさまざまな決済ニーズに対応することで、ECサイト離脱・購入機会の損失を防ぐことができます。

また大手の決済代行会社は導入実績が豊富。サービスの改良が重ねられていて機能が洗練されていたり、セキュリティ上のトラブルが少ないといった傾向があり、多くの企業が現場での使いやすさを評価しています。失敗せずに決済代行サービスを導入したいなら大手の会社もおすすめです。

企業間取引の決済を効率化したいなら、BtoBに特化した「請求代行サービス」がおすすめです。請求代行とは、企業間取引における請求書の発行、発送、代金の回収、入金消込、督促といった業務を一手に引き受けてくれるサービス。この代行サービスを利用することで、経理業務の負荷を大幅に軽減できます。詳しくは下記の記事をご覧ください。