個人事業主向けのオンライン決済代行サービスおすすめ10選！クレジットカード決済導入は必須

目次
• 【比較表】個人事業主向けオンライン決済代行サービス
• 【店舗向け】個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選
• 【ECサイト向け】個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選
• 個人事業主にオンライン決済サービスがおすすめの理由
• 決済代行サービスの選び方
• オンライン決済サービスを導入するメリット
• オンライン決済サービスのデメリット
• まとめ：キャッシュレス決済を導入して新規事業をスタートさせよう
• よくある質問

【比較表】個人事業主向けオンライン決済代行サービス

個人事業主向けのオンライン決済代行サービスはさまざまありますが、「実店舗」に導入するか「ECサイト」に導入するかによっておすすめサービスが異なります。実店舗に決済を導入するならSquareやスマレジがおすすめ。一方でECサイトに決済を導入するならイプシロンやゼウスがおすすめです。

以下では、店舗・ECサイト別におすすめのオンライン決済代行サービスを比較します。

実店舗で対面決済できるサービスを比較すると、初期費用・月額料金が無料のサービスも多い一方で、どのサービスでもクレジットカード決済手数料が発生します。

料金を公開しているオンライン決済代行サービスを比較すると、イプシロン・ゼウスは初期費用無料、月額料金も3,000円程と、安い料金で運用できます。導入コストをかけたくない個人事業主におすすめです。テレコムクレジットは初期費用がかかりますが、クレジットカード決済手数料3.0％～、トランザクション費用1件15円～と他社と比較して安い料金が魅力です。

【店舗向け】個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選

2025年現在、店舗運営する個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選を紹介します。それぞれの特徴や、他社と比較したおすすめポイントを解説しますので、決済代行サービス選びにお悩みの方は参考にしてください。

以上、店舗を運営する個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービスを詳しく解説しました。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、オンライン決済代行サービス選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのサービスがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

【ECサイト向け】個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選

続いて、ECサイトを運営する個人事業主におすすめのオンライン決済代行サービス5選を紹介します。ECサイトのオンライン決済はセキュリティが心配ですが、これまで実績が豊富なサービスを選べば安心です。

個人事業主にオンライン決済サービスがおすすめの理由

経済産業省の調査によると、ECサイトの市場規模は年々大きくなっており、これに伴ってオンライン決済の需要も増加しています。クレジットカードだけでなく、QRコード、電子マネーなど決済方法も多様化し、消費者にとってオンライン決済の利便性は高まっています。

経済産業省の調べによると、２０２１年の国内の物販系ＥＣ市場は前年比９％増の１３兆２８６５億円。巣ごもり需要でＥＣ利用が伸びた。物販系のＥＣ化率は同０．７ポイント増の８．７８％だった。ＥＣの拡大に伴い、決済代行の市場も成長している。(2024/07/16調査)

一方で、決済手段を提供する店舗にとっては、複数のオンライン決済手段を用意する必要があります。個人事業主がオンライン決済を導入するには、複数の審査・手続きを行う必要があり、多くの手間と時間を要します。

そこで、おすすめなのがオンライン決済代行サービスです。オンライン決済代行サービスでは、審査書類の作成や契約手続きを代行し、複数の決済会社と一括契約が可能。スムーズにキャッシュレス決済の導入が完了するため、初めて店舗を持つ個人事業主にもおすすめのサービスです。

総務省の通信利用動向調査によると、消費者のオンライン決済における支払い方法はクレジットカード払いが約8割を占めています。

また、「クレジットカード非対応がもたらす機会損失に関する調査2014」では、クレジットカード非対応の店舗は、クレジットカードを使う潜在顧客の21％の来店機会を失っている結果となりました。

上記の調査より、オンライン決済におけるクレジットカード払いには圧倒的な需要があることがわかります。少しでも販売機会も逃したくない個人事業主は、クレジットカード決済に対応しているオンライン決済代行サービスを選びましょう。

PRONIアイミツ（当サイト）では、希望要件に合った決済代行サービスの案内が可能です。料金無料・最大6社をご紹介しますのでぜひ一度お試しください。

決済代行サービスの選び方

個人事業主向けの決済代行サービスの選び方を解説します。自社のニーズに合う決済代行サービスをお探しの方は参考にしてください。

取り扱う決済方法は決済代行サービスによって異なります。事前に自社の顧客がどのような決済方法を求めているかを調査し、客層に合った決済方法を提供できる決済代行サービスを導入しましょう。

クレジットカード決済は多くの消費者が利用している、馴染み深い決済方法です。クレジットカード決済を利用する顧客が多い場合には、クレジットカードに対応した決済代行サービスがおすすめです。

一方、若年層はスマホアプリ決済をよく利用しており、PayPayなどの話題の決済方法を取り扱うと、それ自体を店舗の強みの一つとしてアピールできます。QRコード決済や後払いなどにも対応した決済代行サービスもあります。→QRコード決済に対応した決済代行サービスはこちら（別記事）

なお、PRONIアイミツSaaS（当社）の調査においては、クレジットカードを導入したいと考える事業者が一番多い結果に。続いて、電子マネーやQRコードのニーズが高くなっています。

入金サイクルとは、キャッシュレス決済で取引した売上金が振り込まれるまでの日数や頻度を指します。決済代行サービスによって入金サイクルは異なり、入金サイクルが早いと資金調達をスムーズに行えます。「入金待ちの間に事業資金が足りなくなった」「資金繰りに困った」という事態にならないよう、決済代行サービスごとの入金サイクルも比較しましょう。

決済代行サービスではクレジットカード情報を含む顧客の個人情報を取り扱います。不正利用や情報漏えいリスクを抑えるために、セキュリティ体制もしっかり比較・確認することが重要です。

公的機関の認証マークを取得した決済サービスは、高いレベルのセキュリティ基準を満たしています。セキュリティ基準の詳細は以下の表を参考にしてください。

高度なセキュリティ対策を実施している決済代行サービスは、セキュリティリスクの発生を抑えられます。決済代行サービスを選ぶ際にはセキュリティ面も考慮しましょう。

以上、決済代行システムの選び方を解説しました。「2025年最新のおすすめ決済代行サービスを徹底比較」では、より詳しい比較選定方法を解説しています。また、2025年最新のおすすめ決済代行サービスも紹介しているので、興味のある方はぜひご覧ください。  

オンライン決済サービスを導入するメリット

個人事業主がオンライン決済代行サービスを導入するメリットを解説します。

多様な決済手段に対応できる決済代行サービスを導入すれば、決済手段不足による顧客のサイト離脱を防げます。SBペイメントの調査によると、顧客自身が希望する決済手段が用意されていない場合、60％以上の顧客が他店舗で商品を購入するという回答が得られました。この結果から、決済手段不足は販売機会を損失する大きな要因になるとわかります。

オンライン決済代行サービスを導入するとさまざまな支払い方法に対応でき、決済手段不足による顧客離脱の防止が可能。さらに、決済手段不足を理由に他店から流出した顧客が自社で購入する機会にも繋がります。

VISAやMastercardなどのクレジットカード会社と直接契約しようとすると、審査申込の書類を準備して提出する必要があります。事務作業にあまり時間をかけられない個人事業主や新規事業者にとって、決済サービスを自力で契約することは現実的ではありません。

決済代行サービスを利用すると、決済代行会社に対してのみ書類を送ればよく、複数の書類を準備する必要はありません。このように、クレジットカード各社の審査の手間が省ける点がメリットです。さらに、「審査が通りにくい」と言われる新規事業者・個人事業主でも審査に通りやすくなるコツを教えてくれるため、初めての方でもスムーズに決済手段を導入できます。

クレジットカード決済代行サービスは、契約手数料を安く抑えられる点がメリットです。複数のクレジットカード会社と直接契約する場合は、各社と契約するための手数料がかかりますが、決済代行サービスを利用すれば決済代行会社1社の契約手数料のみで済みます。「決済サービスの導入費用を抑えたい」個人事業主に決済代行サービスがおすすめです。

PRONIアイミツ（当サイト）では、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った決済代行サービス（最大6社）をご案内可能です。1社1社に問い合わせる手間・ツール選びの時間を大幅に節約できるため、ぜひ一度お試しください。

オンライン決済サービスのデメリット

オンライン決済代行サービスの導入は、個人事業主に多くのメリットがある一方で、デメリットもあります。決済代行サービスの導入時には、次の点に注意してください。

オンライン決済代行サービスは、月額費用・決済手数料などのランニングコストがかかるデメリットがあります。たとえば、クレジットカード決済代行サービスを利用する場合、売上金額の約3％～をクレジットカード決済手数料として支払わなければなりません。加えて、オンラインで決済処理するためのトランザクション費用がかかるサービスもあります。決済手数料は各社のプランや業種、決済手段によって異なるため、事前に把握しておきましょう。

また、店舗向けの決済代行サービスでは、決済端末の費用や月額料金が必要となる場合も多く、それらの費用も予算に含める必要があります。しかし、各決済代行会社との直接契約にかかる手間や自社でシステムを構築・運用するコストを考慮すると費用対効果が高いため、オンライン決済代行サービスは多くの個人事業主におすすめです。

オンライン決済は個人情報を扱うため、不正アクセスや情報漏えいなどのセキュリティリスクが発生します。個人情報の漏えいは、会社の信頼を大きく揺るがす事態になります。お客様も店舗側も双方が安心してキャッシュレス決済を利用するために、高い基準のセキュリティ対策を実施している決済代行サービスを選びましょう。

まとめ：キャッシュレス決済を導入して新規事業をスタートさせよう

店舗やECサイトにキャッシュレス決済を導入することで、販売機会を逃さず、自社の売上にしっかりと繋げることができます。とくにクレジットカードはニーズの高い決済方法のため、個人事業主の方がまず初めに導入するキャッシュレス決済としておすすめです。

PRONIアイミツでは、さまざまな条件でキャッシュレス決済代行を比較できます。導入実績のある業界・企業規模・使いたい機能などで絞り込み、あなたの会社に最適なサービスを探してみてください。
→キャッシュレス決済代行のランキングはこちら

新規事業スタートに適したキャッシュレス決済は多数あるため、どれを導入するべきか迷ってしまう方も多いでしょう。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、決済代行サービス選びについての相談を受け付けています。いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合ったサービスが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。

よくある質問

個人事業主向けのクレジットカード決済・オンライン決済代行サービスについて、よくある質問にお答えします。

個人事業主がクレジットカード決済を導入するには、各クレジットカード会社と直接契約する方法と決済代行サービスを利用する方法があります。

決済代行サービスを利用すると手数料はかかりますが、一括で複数社との契約が完了するため、契約にかかる手間がかかりません。さらに、システム運用を決済代行会社が行うため、トラブル発生時には決済代行会社が対応してくれます。システムのアップデートやメンテナンスも自社で行う必要はありません。

個人事業主にとって、事務作業負担・人手不足が課題になりがちですが、決済代行サービスを利用すれば、契約や運用にかかる時間と手間を大幅に削減できます。簡単に決済手段を整備したい個人事業主には決済代行サービスの導入がおすすめです。

クレジットカード決済はクレジットカード会社との信頼によって成り立つ取引で、審査なしでは導入できません。実際には、取り扱い商材や不正リスクなどが審査されます。

「店舗オープンに合わせて急いで導入したい」「審査に落ちたくない」などの理由からクレジットカードの審査をためらっている方は、クレジット決済代行サービスの利用がおすすめ。クレジット決済代行サービスには、申し込みから数日以内に導入できるものや審査に通りやすくなるアドバイスを教えてくれるものもあります。クレジットカード決済の審査については「オンライン決済・決済代行の審査落ち理由」でまとめています。興味のある方はこちらもご覧ください。