【比較表】請求書システムおすすめ13選！作成・発行や受領などタイプ別に解説

目次
• 【比較表】請求書システムおすすめ13選
• 請求書システムとは
• 請求書システムの4つのタイプ
• 作成特化型のおすすめ請求書システム3選
• 大量配信・効率化型のおすすめ請求書システム2選
• 請求後業務対応型のおすすめ請求書システム4選
• 受領・管理特化型のおすすめ請求書システム4選
• シェアが高い人気の請求書ソフト【当社アンケート調査】
• 乗り換え理由から学ぶ失敗を防ぐポイント
• 請求書ソフトの選び方・比較方法
• まとめ：請求書作成ソフトは機能と費用で比較し、導入するのがおすすめ
• 本記事で利用した調査の概要

【比較表】請求書システムおすすめ13選

PRONIアイミツSaaS（当社）での紹介実績やアンケート結果をもとに、おすすめの請求書システム13製品を比較表にまとめました。料金や導入実績、機能を比較できます。

請求書ソフトを比較したい方は、まずは見積もりから始めてはいかがでしょうか。PRONIアイミツをご利用いただくと、希望要件に合った請求書ソフト（最大6サービス）の無料での一括見積もりが可能です。

請求書システムとは

請求書システムとは、請求書の作成・発行から送付、受領、入金管理までの請求業務をシステム上で効率化・自動化できるサービスです。Excelや紙で行っていた請求書の作成・印刷・封入・郵送といった作業を、まとめて電子化できます。

2024年10月に郵便料金が値上がりしたこともあり、取引先が多い企業ほど、郵送費と作業時間の削減効果は大きくなります。

請求書システムの4つのタイプ

請求書システムは大きく4つのタイプに分けられます。対応する業務範囲はサービスごとに違うため、まずは自社がどのタイプに近いかを把握してから製品を見るといいでしょう。

請求書の作成・発行・送付に機能を絞り込んだタイプです。取引先が数十社程度で、まずは請求書発行を電子化したいという企業に選ばれやすい傾向があります。

▶作成特化型のおすすめ請求書システム3選はこちら

取引先ごとに送付方法（メール・郵送・FAXなど）を使い分けながら、大量の請求書を一斉配信できるタイプです。取引先が100社を超える中堅〜大企業に向いています。

▶大量配信・効率化型のおすすめ請求書システム2選はこちら

入金確認・消込・督促まで自動化し、会計システムとの連携で仕訳作成まで対応するタイプです。経理業務全体を効率化したい企業に向いています。

▶請求後業務対応型のおすすめ請求書システム4選はこちら

取引先から届く請求書の受け取り・確認・管理を効率化するタイプです。紙・PDF・メールなど形式が混在する請求書の受領業務に負担を感じている企業に向いています。

▶受領・管理特化型のおすすめ請求書システム4選はこちら

作成特化型のおすすめ請求書システム3選

請求書の作成・発行・送付に関する機能を標準的にそなえたシンプルで利用しやすい請求書システム3製品を紹介します。

大量配信・効率化型のおすすめ請求書システム2選

取引先が100社を超える中堅〜大企業向きの大量配信・送付が得意な請求書システムを紹介します。

請求後業務対応型のおすすめ請求書システム4選

請求書の作成、発行だけでなく、入金確認・消込・督促まで自動化し、会計システムとの連携で仕訳作成まで一括化できる請求書システムを紹介します。

受領・管理特化型のおすすめ請求書システム4選

取引先から届く請求書の受け取り・確認・管理を効率化するタイプの請求書システムを紹介します。

PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った請求書作成・発行ソフト（最大6社）をご案内可能です。1社1社に問い合わせる手間・ツール選びの時間を大幅に節約できるため、ぜひ一度お試しください。

見積書の作成を効率化したい方は、別記事「おすすめの見積書作成ソフトを徹底比較」もご覧ください。  

シェアが高い人気の請求書ソフト【当社アンケート調査】

PRONIアイミツSaaS（当社）が「請求書システムの利用に関わる従業員」を対象に実施したインターネット調査では、以下のような結果が得られました。具体的なツール名を回答した550人のデータを集計しています。 

シェア上位には、クラウド型で低価格から始めやすい「作成特化型」のサービスが並ぶ一方、法人間取引の基盤を担う「BtoBプラットフォーム 請求書」のような大企業向けサービスも一定の利用率を保っており、企業規模によって選ばれるサービスの傾向が分かれていることがうかがえます。

以下の記事では、「発行」「受領」「発行・受領の両方対応」の3タイプに分けて利用シェアを紹介しています。サービス選びの参考として、ぜひご覧ください。

乗り換え理由から学ぶ失敗を防ぐポイント

当社調査によると、請求書システムを「別のシステムから乗り換えた」と回答した163人に乗り換え理由を尋ねたところ、以下の結果が得られました（複数回答）。

最も多かった乗り換え理由は「他システムとの連携」でした。請求書システム単体の機能だけでなく、自社で使っている会計ソフトや販売管理システム、営業支援システムとどこまで連携できるかを事前に確認しておくことが、乗り換え後の失敗を防ぐ最大のポイントといえます。

次いで「機能不足」「コストの高さ」が続いており、無料トライアルの段階で自社の請求書発行枚数・必要な機能を洗い出し、実際の運用に耐えられるかを確認しておくとよいでしょう。

請求書ソフトの選び方・比較方法

請求書作成・発行ソフトは、機能や料金、導入形態などがサービスによって異なります。請求書ソフトの導入前に、選び方・比較方法をおさえておきましょう。

クラウド型は、税制改正などがあっても自動で最新版にアップデートされる点や導入時のコストを抑えられる点が特徴です。一方のインストール型（パッケージ型）の場合は運用期間が長くなるほど費用を抑えられ、自社サーバーを利用するため情報漏えいやサイバー攻撃といったリスクを回避できる点がメリットと言えます。どちらのタイプがより自社に合っているかを確認したうえで、導入を検討しましょう。

自動仕訳やワークフローなど、自社に必要な機能が搭載されているかどうかも比較すべきポイントです。請求書作成ソフトと言っても、その守備範囲はさまざまなので、業務フローのどの部分をシステム化したいのか、対象規模は合っているのかどうかといった点を確認しましょう。

たとえば、会計処理の負担を軽減したいなら、自動仕訳に対応できる請求書ソフトがおすすめです。あらかじめ勘定科目や取引先、税区分などを設定すれば、請求書を作成すると同時に自動で仕訳データを作成できます。手作業による仕訳入力は登録漏れやミスが発生してしまいがちですが、自動仕訳機能を使えば毎回決められたルール通りの処理が可能です。

また、ワークフロー機能が使える請求書ソフトは、承認フローを所属や役職、請求担当者毎に承認経路が設定できるほか、承認状況の一覧表示もできます。事前に効率化したい範囲を明確にし、必要な機能の洗い出しを行ったうえで比較検討しましょう。

既存の基幹システム、顧客管理システムなどとのデータ連携が可能な請求書ソフトであれば入力業務を大幅に削減できます。たとえば、営業部門でよく使われるSFA（営業支援システム）やCRM（顧客管理システム）と連携できれば、商談情報をもとに請求データを作成することができます。取引先名や売上金額が自動で反映されるため、二重入力の手間が省けます。

なお、連携方法にはCSVファイルとAPIの2種類があります。CSVファイルによる連携は手動でエクスポートとインポートを行い、APIによる連携は自動でデータが反映されます。

会計情報は会社にとって非常に重要なデータのため、請求書ソフトのセキュリティ対策やサポート体制は万全かどうかは必ず比較し選定しましょう。セキュリティ面を判断する基準としては、SSLによる暗号化や2段階認証への対応、不正アクセスの防止、アクセスログの管理などがあります。24時間365日の監視体制や常時バックアップが行われていれば、より高いセキュリティ環境で利用可能です。SOCレポートやISMS、Pマークといった第三者機関による保証も判断材料のひとつです。

また、サポート体制については、自社だけでなく請求書を受け取る取引先への対応も重要です。請求書が電子送信に代わることで理解を得られない取引先もあるため、事前の告知を含めてサポートしてもらえるソフトを選びましょう。

インボイス制度に対応した請求書作成ソフト（請求書発行ソフト）なら、法令を遵守して請求書の発行・保存ができます。適格請求書に対応したフォーマットも作成できるため、効率よく請求業務を行えます。なお、2024年1月以降、インターネット上で発行・受領した請求書などの電子取引データは、原則として電子データのまま保存することが義務付けられています。

電子取引を行った場合には、一定の要件の下で、その電子取引の取引情報に係る電磁的記録を保存しなければならないこととされています（電子帳簿保存法7）。

インボイス制度に加え、電子帳簿保存法に対応した請求書ソフトであれば、要件に沿った電子データ保存ができるため安心して利用できます。インボイス制度の要件に沿った請求書を作成したい方は、別記事「インボイス対応のおすすめ請求書ソフト」も参考にしてください。

初期費用、月額料金、従量課金、オプション料金など、発生する費用をトータルコストで計算し比較しましょう。製品によっては、システムの導入支援費用やサポート費用などはオプション料金が必要になるケースもあるため、導入前の確認をおすすめします。

また、クラウド型か、インストール・パッケージ型かによっても料金体系は異なります。事前に請求書ソフトを利用する人数や取引先数、利用したい機能の範囲などを明確にした上で比較しましょう。

まとめ：請求書作成ソフトは機能と費用で比較し、導入するのがおすすめ

請求書作成・発行ソフトは、シンプルな機能のものから、拡張性の高いプラットフォームになっているもの、総合的な会計ソフトとして機能するものなど様々なシステムがあります。請求書作成・発行だけでなく、受領にも対応するサービスもあるため、請求書作成ソフトは機能と費用で比較し、導入するのがおすすめです。

PRONIアイミツでは、さまざまな条件で請求書作成・発行ソフトを比較できます。導入実績のある業界・企業規模・使いたい機能などで絞り込み、あなたの会社に最適なサービスを探してみてください。
→請求書作成・発行ソフトのランキングはこちら

しかし、請求書ソフトは多数あり、どれを導入すべきか迷ってしまうでしょう。PRONIアイミツでは、ITツール受発注支援のプロとして、請求書ソフト選びについての相談を受け付けています。いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った請求書ソフトが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。

本記事で利用した調査の概要