クラウド請求書システムの選び方を徹底解説！おすすめのサービスも比較

目次
• クラウド請求書システムとは
• クラウド請求書システムの選び方・比較ポイント
• クラウド請求書システムが取り扱う範囲
• クラウド請求書システムを導入するメリット
• クラウド請求書システムを選ぶ際の注意点
• おすすめのクラウド請求書システム4選
• まとめ：機能・料金を比較し、自社に合う請求書システムを選ぼう

クラウド請求書システムとは

クラウド請求書システムとは、請求書作成・発行を効率的に行うことを目的とした業務システムです。導入することで、請求書の発行に関する一連の作業の自動化が可能となります。中には請求書だけでなく見積書や注文書、納品書、検収書などの作成・発行に対応している製品や、会計ソフトやSFA（営業支援システム）などと連携できる製品もあります。

クラウド請求書システムはインターネット環境があればどこでも利用できるため、外出先で作業をしたい方や社内での情報共有に力を入れたい方に最適。ペーパーレス化にもつながるので、コストダウンを図りたいという場合にもおすすめです。

PRONIアイミツSaaS（当社）が2025年5月～9月に実施した独自調査では、企業が請求書システムを導入する目的・背景は「請求書の管理・処理工数を削減したい」が64%と最も多い結果に。次いで、「インボイス制度に対応したい」が60%、「毎月の請求業務を自動化したい」が45%、「電子帳簿保存法に対応したい」が39%でした。

上記の調査結果から、請求業務の効率化だけでなく、法改正への対応を図るために多くの企業が請求書システムの導入を検討していることが分かります。クラウド型のシステムであれば、場所を問わずに業務を効率化できるうえ、法改正には自動バージョンアップデートで対応するため手間がかかりません。クラウド請求書システムの導入により、担当者は他の業務にリソースを割けるようになります。企業の生産性向上の観点からも、クラウド型システムはおすすめです。

クラウド請求書システムの選び方・比較ポイント

ここでは、クラウド請求書システムの選び方・比較ポイントについて解説します。業務システムは自社ニーズとマッチしたものを選ぶことが大切です。導入する際は次の選び方・比較ポイントに注意してください。

クラウド請求書システムは各社から提供されており、実装している機能はそれぞれ異なります。そのため、システム導入時には自社の業務形態に適しているものを選ぶようにしましょう。「業務形態と合っているかわからない」という場合には、過去の実績を確認するのがおすすめ。自社と近しい規模・業態の会社に多く導入されているシステムなら、相性がよいと考えられます。

また、請求業務に関する課題・問題点を洗い出すというのも大切なポイント。課題解決や目的達成にぴったりの機能を持つクラウド請求書システムが見極められれば、スピーディーな業務効率化も夢ではありません。

インボイス制度や電子帳簿保存法といった法改正に対応する請求書を作成できるかも大事な比較ポイントです。法改正に対応するシステムであれば、法律に則った書類を発行できるだけでなく、煩雑になりがちな請求業務を効率的に進められます。

クラウド請求書システムを選ぶ際には、「既存システムとの連携」も重要な判断ポイントです。業務の自動化を目的にシステムを導入しても、既存システムと連携ができなければ手入力が必要となるため、必ず確認してください。人気製品であっても、既存システムとの連携が難しいものは候補から外すのが得策でしょう。

なお、請求書の発行数が多い場合には、API連携が可能なシステムがおすすめです。それほど多くないという場合は、CSVファイルのインポートでも問題なく処理することができます。

自社の業務フローとの相性も、クラウド請求書システムを選ぶ際のポイントといえます。現状の請求業務フローを踏まえた上で、新たにクラウド請求書システムを導入した場合はどのように業務を進めるのかをシミュレーションしておきましょう。

たとえば、請求書の発行前に上長承認が必要ならば、その流れも含めてシステム化することが大切。請求書作成・発行だけならば製品ごとに大きな違いはありませんが、業務フローにどう組み込むかによって選ぶべき製品が異なってくるので注意が必要です。

クラウドサービスは高い利便性を持つ一方で、サイバー攻撃の潜在的なリスクを抱えているというのも事実。クラウド請求書システムでは取引先の情報を扱うことになるため、セキュリティ面も重要な要素です。多くのサービスが通信暗号化やアクセス権限設定などを通じてセキュリティ対策を行っていますが、内容はそれぞれ異なるので詳細をしっかりと確認しましょう。

また、セキュリティ対策に関する情報は多くのサービスが公開していますが、不明点や疑問点がある場合には問い合わせをするのがおすすめです。

以上、請求書システムの比較ポイントを解説しました。早速サービスを比較したい方は、別記事「おすすめの請求書作成・発行ソフトを比較【2025年最新】」もぜひ参考にしてください。

クラウド請求書システムの導入を検討中の方は、ぜひPRONIアイミツ（当サイト）をご活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合ったクラウド請求書システム（最大6社）をご案内可能です。1社1社に問い合わせる手間・ツール選びの時間を大幅に節約できるため、ぜひ一度お試しください。

クラウド請求書システムが取り扱う範囲

クラウド請求書システムを導入すると、請求書の作成から送付作業、入金確認までのプロセスの一元管理が可能になります。システムによって取り扱う範囲は異なりますが、中には売り上げ集計や損益管理、仕訳データ作成、債権管理などに対応している製品も存在します。

導入する際には、自社のニーズを明確にした上で課題解決・目的達成に必要な範囲をカバーしている製品を選びましょう。ここからは、クラウド請求書システムが取り扱う範囲について解説します。

クラウド請求書システムを使用すると、請求書や見積書の作成が自動化できます。複数のフォーマットが用意されているケースが大半で、必要項目を入力するだけで手軽に請求書や見積書の作成が可能。一度入力した内容を次回以降は省略できるなど、業務効率化に貢献する機能を具えているものも存在しています。

また、中には請求書や見積書の送付時に添付する送付状の作成もワンストップで行えるシステムもあります。

クラウド請求書システムを導入すれば、請求書に関わる業務のオンライン化が可能です。メールでの請求書送信もボタンをクリックするだけで作業が完了するため、請求先の企業側の了承が得られれば発送作業が不要で請求書送付が行えます。

郵送となると印刷や発送の手間だけでなく、請求書の到着にも時間を要します。また、手作業で請求業務を行うとなると、取引先が多いほどに人手が必要になるものです。それらの作業をシステム上で効率的に進められれば、業務負担の大幅な軽減につながるでしょう。

しかし、クラウド請求書システムの中には郵送代行に対応しているものもあるので、請求先の企業が電子化に未対応の場合には必ず確認してください。料金は従量課金制で1通あたり150～200円程が一般的のようです。

大半のクラウド請求書システムが、CSV形式のデータインポート・エクスポートに対応しています。API連携に対応しているクラウド請求書システムなら、会計ソフトとの連携もシームレス。基幹システムと連携させれば顧客情報も反映させることができます。常に最新情報で請求書が自動送付されれば経理業務が大幅に効率化できるだけでなく、コスト削減にもつながるでしょう。

クラウド請求書システムの中には、金融機関との連携による請求・入金管理の自動化や、未入金の請求先に対する催促にも対応しているシステムがあります。入金名などが一致しない場合であっても、一度消し込み作業を行えば次回以降は自動化できることも。入金状況を逐一確認する必要がなくなるため、この機能も経理業務の効率化に役立ちます。

クラウド請求書システムを導入するメリット

ここからは、クラウド請求システムを導入するメリットについて解説します。システムによって実装されている機能は異なりますが、標準的な機能を持った製品であれば以下のようなメリットが期待できます。

クラウド請求書システムを導入する最大のメリットは、請求業務の大幅な効率化が実現するという点です。必要事項を入力するだけで請求書が作成できるだけでなく、会計システムをはじめとする他システムと連携させれば都度データを入力する必要もありません。

定期的に同じ請求書を作成する場合は、「予約配信機能」のあるクラウド請求書システムを選べば自動発行が可能に。場所を問わず、パソコンだけでなくスマートフォンからも操作ができるというのもクラウド型のシステムならではの魅力です。

クラウド請求書システムでは、請求書の発行から発送、入金確認までのプロセスが自動化できるため、人為的なミスの防止が可能です。人の手による作業には請求漏れや誤請求が発生するリスクがあり、会社としての信頼を損なう可能性もあります。

クラウド請求書システムを導入すれば、請求に関する一連の作業が自動化できるため、人為的なミスが発生する余地がなくなります。ダブルチェックなどに費やす時間・労力も不要となるため、リソースの最適化も叶うでしょう。

コスト削減への貢献が期待できるというのも、クラウド請求書システムの導入メリットの1つです。請求書が電子化できればペーパーレスが推進でき、用紙代や印刷代、郵送代などの削減になります。また、印刷した請求書や送り状の封入や宛名作成も不要となるため、業務負担の低減も叶うでしょう。

「請求先が電子化に対応していない」という場合は、郵送代行サービスのあるクラウド請求書システムを利用するのも1つの手段。請求書の送付業務の負担が大きい場合には検討してみてください。

請求書システムにはメリットだけでなくデメリットもあります。システムを導入する前に抑えておきたい方は、別記事「Web請求書のメリット・デメリット」も参考にしてください。

PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、クラウド請求書システム選びについての相談を受け付けています。いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合ったクラウド請求書システムが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。

クラウド請求書システムを選ぶ際の注意点

さまざまなメリットがあるクラウド請求書システムですが、導入に際してはいくつかの注意点があります。

クラウド請求書システムは月額制が大半なので、利用し続ける限り料金が発生します。長期利用を前提とする場合は「ランニングコスト」「費用対効果」をしっかりと確認・検証することが必要です。

また、新たにシステムを導入する場合には、社内での定着までに時間を要するのも事実。どんなに優れたシステムであっても使われなければ意味がありません。よりスムーズに社内での使用を浸透させるためにも、操作性の高いシステムを選ぶようにしましょう。可能であれば無料トライアルを活用し、導入前に使用感を確かめてみるというのもおすすめです。

おすすめのクラウド請求書システム4選

ここからは、とくにおすすめのクラウド請求書システムを紹介します。いずれも多くの企業に導入されている人気製品で、操作性にも定評があるようです。導入する際はぜひ参考にしてください。

以上、おすすめのクラウド請求書システムを紹介しました。なお、個人事業主やフリーランスの方におすすめのサービスは、別記事「個人事業主向けのおすすめ請求書ソフト」で詳しく紹介しています。無料プランや無料トライアルから始められるサービスもありますのでぜひ参考にしてください。

まとめ：機能・料金を比較し、自社に合う請求書システムを選ぼう

この記事では、クラウド請求書システムの概要や導入メリット、製品の選び方とあわせて、おすすめのクラウド請求書システムを紹介してきました。請求書の作成・発行から入金確認までのプロセスが自動化できるクラウド請求書システムは、請求業務の大幅な効率化に役立つシステムです。ペーパーレス化によるコスト削減が期待できるというのも魅力的なポイントでしょう。複数のサービスの機能・料金を比較し、自社に合う請求書システムを選びましょう。

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  2025年最新でおすすめのクラウド請求書発行システムを知りたい方は、別記事「クラウド請求書発行システムを徹底比較」もぜひ参考にしてください。