決済代行会社の手数料相場は？格安でおすすめのサービスも比較

目次
• 決済代行の手数料相場はどれくらい？【アンケート調査】
• 販売形態別の決済手数料の相場
• 決済手段ごとの手数料の相場
• 決済代行サービスの初期費用・月額料金の相場
• 決済代行サービスの手数料【比較表】
• 格安でおすすめの決済代行サービス7選
• 決済代行サービスの比較選定ポイント
• 決済代行会社を利用するメリット
• まとめ：費用対効果の高い決済代行会社を選ぼう
• よくある質問
• 決済代行サービス・キャッシュレス決済の利用実態アンケートの概要

決済代行の手数料相場はどれくらい？【アンケート調査】

決済代行サービスを利用する際、最も大きな変動費となるのが「決済手数料」です。今回PRONIアイミツSaaS（当社）は、決済代行サービス・キャッシュレス決済を導入・利用している担当者400名にアンケート調査を実施。利用中の決済代行サービスにかかる決済手数料や初期費用・月額料金について質問し、回答をまとめました。

アンケートの結果、決済代行サービスの決済手数料の分布で最も多かったのは「3.0〜3.2%（20.00%）」、次いで「3.3〜3.4%（19.00%）」でした。

【決済代行の決済手数料・回答レンジ上位】

全体の約4割が「3.0〜3.4%」の範囲に収まっており、3.2%前後が現在の市場における決済手数料の標準的な相場と言えます。

販売形態別の決済手数料の相場

販売形態（業態）によって、決済代行会社から提示される手数料率には明確な傾向の違いが見られました。

ECサイト（N=125）では、「3.0〜3.2%（26.4%）」が最多となり、次に「3.3〜3.4%（21.2%）」が続きます。オンライン決済は対面決済に比べてリスク管理コストが含まれるため、3%台が主流となっています。  

サブスク（N=58）においては、「3.3〜3.4%（32.8%）」が突出して高い結果となりました。継続課金は運用の手間や管理機能の充実が求められるため、一般的なECサイトよりもやや高めのレンジに設定される傾向があります。
→サブスク・継続課金におすすめの決済代行サービス（別記事）

実店舗（N=123）は他の業態と比較して低料率の傾向が強く、「2%未満」が13.0%、「2.0〜2.9%」が21.1%と、3%を切る割合が計34.1%に達します。対面決済特有の競争激化とリスクの低さが、料率の押し下げ要因となっていると推察されます。

特定の用途や市場に特化した販売形態についても、アンケートから特徴的なコスト構造が見えてきました。

  【決済手数料の最多ボリュームゾーン】

月謝・スクール（N=33）は「3.0〜3.2%（21.2%）」が最多ですが、特筆すべきは「3.5〜3.9%（18.2%）」という高料率層の多さです。月謝の自動引き落としなど、継続的な口座振替やカード決済の運用コストが反映されています。

イベント・セミナー（N=21） は、「3.3〜3.4%」が33.3%と突出しています。単発かつ短期間に決済が集中するイベント利用では、料率の引き下げ交渉が難しく、市場の標準的な手数料率（3%台前半）がそのまま適用されている実態が伺えます。  

越境EC（N=10）は分母は小さいものの、他業態に比べて明確に「高コスト」な傾向にあります。「3.3〜3.4%」が30.0%を占め、さらに「3.5〜3.9%」や「4.0%以上」といった高料率層も目立ちます。為替手数料や海外ブランドのライセンス料が上乗せされるため、越境ECを検討する際は3.5%前後を最低ラインとして予算を組むのが現実的と言えるでしょう。 

決済手段ごとの手数料の相場

利用する決済手段によっても、手数料の構造は異なります。以下では、決済手段ごとの手数料相場をグラフ化しました。

最も利用者の多いクレジットカード決済（N=267）では、「3.0〜3.2%（22.5%）」が最多です。国際ブランド（VISA/Mastercard等）によっても変動しますが、概ね3%台前半が相場です。  

口座振替の手数料は、「3.0〜3.2%」と「3.3〜3.4%」が同率で19.1%となり、これがボリュームゾーンとなっています。特徴的なのは、「2%未満」の割合が13.5%と、QRコード決済（8.1%）やコンビニ決済（2.0%以下）に比べて高い点です。  

QRコード決済（N=210）は、「3.0〜3.2%（22.9%）」と「3.3〜3.4%（21.4%）」に回答が二分されています。一時期の無料キャンペーン期を経て、現在はクレジットカードと同等か、わずかに高い水準で推移しています。  

主要な決済手段以外でも、電子マネーやキャリア決済、銀行振込などは根強い需要があります。

  【決済手数料の最多ボリュームゾーン】

電子マネー（N=166）は「3.0〜3.2%」と「3.3〜3.4%」が共に22.9%となり、全体の約45%が3%台前半に収まっています。クレジットカード決済とほぼ同等の相場感で運用されていることが分かります。  

コンビニ決済（N=101）は「3.0〜3.2%（25.7%）」がボリュームゾーンです。他の決済手段と異なり、「5.0%以上」と回答した割合が11.9%と高くなっているのが特徴です。キャリア決済（N=131）は 「3.0〜3.2%（20.6%）」が最多ですが、3.5%以上の高料率層も計32.8%存在します。

銀行振込（N=185） で特筆すべきは、「2%未満」と回答した割合が16.2%にのぼり、全決済手段の中でもトップクラスに低い点です。これは、決済代行会社を通さず自社口座を介する場合や、BtoB取引における固定額の手数料設定が多いためと考えられます。

決済代行サービスの初期費用・月額料金の相場

決済代行サービスの導入には、決済手数料以外にも「初期費用」と「月額利用料」という固定費が発生する場合があります。アンケート結果から、それぞれの最新の相場を見ていきましょう。

決済代行サービスの初期費用において、最も多かった回答は「5万円〜10万円未満（18.75%）」でした。一方で「0円（初期費用なし）」と回答した企業も14.75%にのぼります。

【決済代行の初期費用・回答レンジ上位】

初期費用が有料の決済代行サービスは、自社のニーズに合わせてシステムをカスタマイズ・開発してくれる点がメリット。導入サポートが手厚いことも多いです。独自のシステム連携や大規模な導入が必要な場合には、10万円〜30万円以上のコストが発生するケースも珍しくないことが分かります。

初期費用が無料の決済代行サービスは、汎用的で使いやすいシステムである一方で、個々の店舗に合わせたカスタマイズに対応していない場合が多いです。カスタマイズする場合はオプション機能料金がかかります。しかし、導入コストを大幅に抑えられるため、予算が限られる企業におすすめです。

決済代行サービスの月額利用料については、「5,000円〜9,999円（18.50%）」がボリュームゾーンとなっており、次いで「1,000円〜4,999円（14.75%）」が続いています。

  【決済代行の月額料金・回答レンジ上位】

1万円未満で運用している企業が全体の約4割を占めており、低コストなプランを提供するサービスが主流であることが伺えます。ただし、サポート体制や機能の拡充に応じて、月々1万円〜3万円、あるいは5万円以上を支払っている層も一定数存在します。  

月額料金にはシステム利用料やデータ管理費用が含まれ、実店舗なら決済端末のリース代も加わります。月額料金は決済手段の種類によっても変わるため、各社の決済手段ごとの手数料を比較することをおすすめします。

決済代行サービス利用時には、初期費用・月額料金・決済手数料以外にも、決済1件ごとに数円〜数十円が発生する「トランザクション手数料」や、売上金の入金時に1回の振込あたり無料〜数百円が発生する「振込手数料」などが別途加算されます。

トランザクション手数料とは決済時のデータ転送にかかる通信費です。決済手数料と混同されやすいですが、決済手数料はオンライン決済の価値自体に支払われる手数料で、トランザクション手数料は通信費です。

総コストを比較する際は、これら周辺費用のシミュレーションも欠かせません。上記の手数料は決済代行会社によって無料の場合もあるため、実際の料金は見積もりを取って確認しましょう。 

決済代行サービスの導入を検討中の方は、ぜひPRONIアイミツ（当サイト）をご活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った決済代行サービス（最大6社）をご案内可能です。

決済代行サービスの手数料【比較表】

ここからは実際に、決済代行サービスの手数料を比較します。以下、初期費用・月額料金・手数料・トランザクション手数料の比較表をご覧ください。

料金を比較すると、「Airペイ」「Square」「atone」は初期費用・月額料金ともに無料と、安い費用で利用できる決済代行サービスです。また、「ペイゲート」はカード決済手数料が1.98%～と低いため、決済件数が増えても手数料を安く抑えられます。

格安でおすすめの決済代行サービス7選

料金プランを比較した結果、格安でおすすめの決済代行サービス7選を紹介します。各サービスの特徴や、他社と比較したおすすめポイントを紹介しますので、決済代行サービス選びにお悩みの方は参考にしてください。

以上、手数料比較でおすすめの決済代行サービスを詳しく解説しました。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、決済代行サービス選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのサービスがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

決済代行サービスの比較選定ポイント

失敗せずに決済代行サービスを選ぶには、手数料だけでなく、決済手段や入金サイクル、セキュリティの比較も重要です。ここでは決済代行サービスの比較選定ポイントを解説します。

決済代行サービスが取り扱う決済方法は提供会社によって異なります。事前に自社の顧客がどのような決済方法を求めているかを調査し、客層に合った決済方法を提供できる決済代行サービスを導入しましょう。

例えば、若年層向けの事業を行っている場合、PayPayなどの話題の決済方法を取り扱うと、それ自体を店舗の強みの一つとしてアピールできます。逆にアプリ決済よりもクレジットカード決済に馴染みのある世代が多い場合は、クレジットカードに対応した決済代行サービスがおすすめです。QRコード決済や後払いなどにも対応した決済代行サービスもあります。

入金サイクルとは、キャッシュレス決済で取引した売上金が振り込まれるまでの日数や頻度を指します。決済代行サービスによって入金サイクルは異なり、入金サイクルが早いと資金調達をスムーズに行えます。

早めに資金を確保したい場合に、早期入金サービスというオプションを利用できることも。「入金待ちの間に事業資金が足りなくなった」「資金繰りに困った」という事態にならないよう、決済代行サービスごとの入金サイクルも比較しましょう。

キャッシュレス決済は顧客のクレジットカード情報や口座情報などの個人情報を取り扱います。情報漏えいが発生した場合、顧客や取引先の信頼を大きく損なうため、セキュリティ対策が万全の決済代行サービスを選ばなければなりません。

例えば、クレジットカード情報を安全に取り扱うための基準である「PCI DSS」や、情報マネジメント管理基準の「ISMS認証」を受けている決済代行サービスは高いセキュリティ基準を満たしており、セキュリティリスクの発生を抑制できます。また、クレジットカードの不正利用防止には「3Dセキュア」や「トークン決済」を取り入れている決済代行サービスがおすすめです。

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決済代行会社を利用するメリット

決済代行会社を利用するとどのようなメリットがあるのか、おさらいします。

決済代行サービスによって豊富な決済手段を用意できれば、顧客の多様な支払いニーズに対応できます。これによって、「自分が使える決済手段がない」という理由で店舗やサイトを離脱する顧客を減らせます。

実際にSBペイメントの調査では、「よく利用する支払い手段が利用できない場合、60％以上の方が他の店舗で購入する」と答えました。

この結果から、決済手段不足は顧客が離脱する大きな要因とわかります。決済代行サービスは決済手段が豊富なため、決済手段不足による購入機会損失の防止が可能です。

自社で複数の決済会社と直接契約する場合、各決済方法ごとに売上を管理する必要があり、集計業務が煩雑になります。しかし、決済代行サービスを利用すると、複数の決済手段の売上を一元管理でき、手間なく集計が可能です。

また、入金においても、決済会社ごとに入金日や入金サイクルが異なりますが、決済代行サービスでは複数の決済手段での売上金がまとめて入金されるため、経理業務の手間を軽減できます。

複数の決済機関と個別契約する必要がなく、導入時の契約手数料を安く抑えられる点が1つ目のメリットです。決済代行サービスを利用せずに複数社と直接契約すると、それぞれの決済機関に契約手数料を支払わなければなりません。

決済代行サービスは一括で複数の決済機関と契約するため、決済代行会社の契約手数料を支払うだけで契約可能。イニシャルコストを抑えてキャッシュレス決済を導入できます。

まとめ：費用対効果の高い決済代行会社を選ぼう

本記事では、手数料を比較し、格安でおすすめの決済代行会社を紹介しました。費用対効果の高い決済代行サービスを選ぶには、自社の客層に合った決済手段を導入できるか、など機能面の比較もポイントです。

PRONIアイミツでは、さまざまな条件で決済代行サービスを比較できます。導入実績のある業界・企業規模・使いたい機能などで絞り込み、あなたの会社に最適なサービスを探してみてください。→決済代行サービスのランキングはこちら

しかし、決済代行サービスは多数あり、どれを導入すべきか迷ってしまうでしょう。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、決済代行サービス選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめの決済代行サービスがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

よくある質問

決済代行サービスについて、よくある質問に答えます。

決済代行サービス経由でクレジットカード決済を行う際の仕組みは、下記の通りです。

決済代行サービスを利用していない場合、加盟店は複数のアクワイアラとやりとりしなければなりません。決済代行サービスを利用すると手続きが一括で完了し、返金や入金トラブルがあった際も決済代行サービスが対応してくれます。管理が煩雑になりがちなキャッシュレス決済の運用がスムーズにでき、システム運用の手間やコストを大幅に削減可能です。

クレジットカード決済の導入費用や相場については「クレジットカード決済の導入にかかる手数料相場」で詳しく解説しています。興味のある方はこちらもぜひご覧ください。

クレジットカード加盟店手数料を安く抑えるには、カード会社と直接契約するのではなく、決済代行サービスを利用するのがおすすめです。1社1社のカード会社と個別契約するための手数料が発生しないほか、ネットワーク構築・運用のコストも安くなるためです。

クレジットカード会社と直接契約する場合と、決済代行サービスを利用する場合を比較した表をご覧ください。

コストを抑えてクレジットカード決済を使いたい場合は、複数社の相見積もりをとり、手数料を比較しましょう。

決済代行サービス・キャッシュレス決済の利用実態アンケートの概要

この記事にまとめた決済代行サービス・キャッシュレス決済の利用実態アンケートの概要です。

当記事の引用や転載をする際は、必ず出典として「PRONIアイミツSaaS」および記事URL（https://saas.imitsu.jp/cate-talent-management/article/h-585）を明記願います。