オンライン決済システムおすすめ10選【2025年最新比較】

目次
• オンライン決済システムとは
• オンライン決済システムの比較表（ECサイト・店舗別）
• 【ECサイト向け】おすすめオンライン決済システム5選
• 【店舗向け】おすすめオンライン決済システム5選
• オンライン決済システムを導入するメリット
• 失敗しないオンライン決済システムの選び方
• まとめ：キャッシュレス決済を導入して売上アップを目指そう
• よくある質問

オンライン決済システムとは

オンライン決済システムとは、クレジットカードをはじめ、QRコード決済、電子マネー決済など、さまざまな決済手段を一括で導入できるシステムです。店舗やECサイトに決済サービスを導入するための契約手続きや、売上管理も一括で行うことができます。

オンライン決済システムを導入すれば、各決済機関と個別に契約する必要がなくなり、手間なくスムーズにキャッシュレス決済を利用できるようになります。

国内におけるキャッシュレス決済比率は年々高まっており、2024年には約4割がキャッシュレスで決済されています。なかでも、クレジットカード決済は多くの消費者が利用しており、需要の高い決済手段です。

2024年のキャッシュレス決済比率は堅調に上昇し、42.8%（141.0兆円）となりました。その分子の内訳は、クレジットカードが82.9％（116.9兆円）、デビットカードが3.1％（4.4兆円）、電子マネーが4.4％（6.2兆円）、コード決済が9.6％（13.5兆円）でした。

よく利用される決済手段の種類を紹介します。

オンライン決済は、どのような仕組みで成り立っているのでしょうか。決済方法によって仕組みに違いはありますが、最もメジャーなクレジットカード決済の仕組みを紹介します。

消費者が店舗でクレジットカード決済を行うと、カード会社の決済ネットワークを通じて決済処理が走ります。その際に与信枠（カードを問題なく利用できるか）も確認され、問題なければ支払いが完了します。

なお、ECサイトや店舗は、事前に決済代行会社と加盟店契約を結ぶ必要があります。決済代行会社はカード会社の代わりに店舗と契約を行う業者で、この契約によって複数のキャッシュレス決済（クレカ、電子マネー、QRコード等）を一括で導入することが可能です。

オンライン決済システムの比較表（ECサイト・店舗別）

ここからは実際に、オンライン決済システムを比較して、導入におすすめのサービスを紹介します。以下、ECサイト・店舗別にオンライン決済代行システムを比較した表をご覧ください。

下記は、ECサイトへの導入実績が豊富なオンライン決済システムを比較した表です。

多くのサービスは公式サイトで料金を公表しておらず、見積もりが必要です。料金を公開しているオンライン決済システムを比較すると、初期費用無料、月額料金も3,000円程と、安いコストで導入できます。

下記は、実店舗への導入実績が豊富なオンライン決済システムを比較した表です。

料金を公開しているオンライン決済システムを比較すると、初期費用・月額料金ともに無料と、コストをかけずに導入できます。決済時、1回ごとに発生するクレジットカード決済手数料は、約3%～4%が相場です。

【ECサイト向け】おすすめオンライン決済システム5選

2025年現在、ECサイト・ネットショップにおすすめのオンライン決済システム5選を紹介します。ECサイトのオンライン決済はセキュリティが心配ですが、これまで実績が豊富なサービスを選べば安心です。

以上、ECサイトにおすすめのオンライン決済システムを紹介しました。決済サービスは多数あるため、どれを選ぶべきか迷ってしまう方も多いでしょう。PRONIアイミツは、ITツール受発注のプロとして、希望要件に合った決済サービスの案内が可能です。料金無料・最大6社をご紹介しますのでぜひ一度お試しください。

【店舗向け】おすすめオンライン決済システム5選

続いて、実店舗におすすめのオンライン決済システム5選を紹介します。

オンライン決済システムを導入するメリット

オンライン決済システムを導入することで、得られるメリットを紹介します。

顧客のニーズはさまざまで、クレジットカードを利用したい方もいれば、キャリア決済で支払いたいという方もいるでしょう。そのため、1つの決済方法に絞って導入するよりも複数の支払い方法に対応したオンライン決済システムを導入するのがおすすめです。販売機会を逃さないためにもオンライン決済の導入は有効といえます。

また、継続課金に対応しているオンライン決済システムであれば、定期購入プランも用意できるため、手間をかけずに継続的な収益獲得に繋げられます。

VISAやMastercardなどのクレジットカード会社と直接契約しようとすると、審査申込の書類を準備して提出する必要があります。事務作業にあまり時間をかけられない新規事業者にとって、自力で1社1社と契約することは現実的ではありません。

決済代行会社と契約すると、決済代行会社に対してのみ書類を送ればよく、複数の書類を準備する必要はありません。このように、クレジットカード各社の審査の手間が省ける点がメリットです。

クレジットカード会社ごとに直接契約してしまうと、それぞれ入金日も異なり、売上管理が煩雑になってしまいます。しかし、オンライン決済システムなら、各種キャッシュレス決済をまとめて管理でき、売上を把握しやすくなります。さらに、「カード決済が失敗している」などの決済状況もリアルタイムで確認できます。

従来のような後払いの仕組み（顧客が商品を購入した後に、代金を支払う仕組み）では、未入金のリスクが常に存在していました。しかし、クレジットカード決済やキャリア決済を導入することで、自動で口座から引き落としがされるため、未入金の心配がなくなります。資金繰り・キャッシュフローの安定につながるでしょう。

失敗しないオンライン決済システムの選び方

オンライン決済システムを提供する企業は多数あり、どれを選ぶべきか迷う方も多いでしょう。ここでは、サービス選びを失敗しないために気を付けるポイントを解説します。

対応する決済手段は、オンライン決済システムごとに違いがあります。事前に自社の顧客がどのような決済方法を求めているかを調査し、客層に合った決済方法を提供できるサービスを導入しましょう。

最も決済ニーズの高いクレジットカードは、ぜひ導入したい決済手段です。一方、クレジットカードを持たない顧客をターゲットとする事業者には、次に決済ニーズの高いコンビニ決済やQRコード決済もおすすめです。

オンライン決済システムの利用には、決済手数料・初期費用・月額料金がかかります。

決済手数料は商品やサービスが売れるたびにかかるコストで、決済手段ごとに異なります。たとえば、クレジットカード決済では売上金額の約3％、コンビニ決済では1回の決済ごとに数百円の決済手数料がかかります。オンライン決済システムを選ぶ際には、各社を相見積もりで比較するのがおすすめです。

オンライン決済では個人情報を扱うため、不正アクセスや情報漏えいを防ぐセキュリティ対策が重要です。オンライン決済システムのセキュリティ対策や実績を比較し、安全なサービスを選びましょう。

公的機関の認証マークを表示しているサービスは、高いレベルのセキュリティ基準を満たしています。各セキュリティ基準の詳細は以下の表を参考にしてください。

また、消費者とのトラブルやシステムトラブルが発生した際の、サポート体制も確認しましょう。電話やメールですぐに連絡がつき、手厚いサポートが受けられる決済代行会社なら、安心して運用できます。

入金サイクルとは、キャッシュレス決済で取引した売上金が振り込まれるまでの日数や頻度を指します。入金サイクルが遅いと資金繰りに困る可能性があるため要チェックです。

毎月2～4回締めで定期的に入金があるサービスや、入金サイクルをより早めるオプションがあれば安心です。「入金待ちの間に事業資金が足りなくなった」「資金繰りに困った」という事態にならないよう、オンライン決済システムごとの入金サイクルも比較しましょう。

ECサイトにオンライン決済システムを導入する際には、自社のECサイトとの連携可否をチェックしましょう。MakeShopやShopify、EC-CUBEなどのツールと連携できるオンライン決済システムを選べば、手間なくスムーズにキャッシュレス決済を導入できます。

まとめ：キャッシュレス決済を導入して売上アップを目指そう

ネットショップや実店舗に、クレジットカードをはじめとしたキャッシュレス決済を導入することで、顧客の決済ニーズを満たすことができます。結果として販売機会の損失を防ぎ、店舗の売上アップにつなげることも可能です。

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とはいえ、数ある決済代行サービスを比較して自社のニーズに合ったものを選ぶのは大変です。「まず候補を絞りたい」という担当者はぜひPRONIアイミツを活用ください。PRONIアイミツでは、いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った決済代行サービスが分かる診断（無料）ができます。

よくある質問

オンライン決済システムについて、よくある質問に答えます。

現金決済と比較した際、オンライン決済システムは決済手数料などのコストが発生する点がデメリットといえます。決済手数料の相場は売上金額の2.5%〜4%で、決済手段や取り扱う商材によって幅があります。 例えば、クレジットカード決済なら2.5%〜4%、電子マネー決済なら3〜4％と、同じ商材でも決済手段によって決済手数料が異なります。

しかし、オンライン決済システムを利用することで売上管理や審査手続き、セキュリティ対策の手間がなくなるため、管理コストを削減できる面もあります。

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