電子帳票システムの料金を徹底比較！価格相場も解説

目次
• 電子帳票システムの価格相場
• 電子帳票システムの料金プラン比較
• 【2025年最新】おすすめの電子帳票システム5選
• 電子帳票システムとは
• 電子帳票システムを選ぶ際のポイント
• 電子帳票システムのメリット
• まとめ：価格を抑えて電子帳票システムを導入しよう

電子帳票システムの価格相場

電子帳票システムを導入するには、初期費用と月額料金が必要です。おおよその相場感は上記に示した通りで、カスタマイズやオプションがあれば別途料金がかかります。

初期費用は一律固定である一方で、月額料金は複数のプランから選択可能です。プラン毎に利用できる機能や帳票数、連携範囲などは異なり、事業規模に合わせたプランで運用できます。利用中に帳票数が上限を超えた場合でも、超過した枚数分だけ加算されるしくみのため、システムを止めることなく業務を続けられます。

また、インターネットFAXや郵送代行といった配信機能では、件数に応じて別費用が発生します。予算の範囲内で運用するには、見積もりの際にトータルで試算することをおすすめします。

電子帳票システムの料金プラン比較

ここからは実際に、電子帳票システムの料金やJIIMA認証の有無を比較していきます。以下は、主要な電子帳票システムの比較表です。自社に導入する電子帳票システムを検討している経理・財務担当者はぜひ参照ください。

【2025年最新】おすすめの電子帳票システム5選

2025年現在、おすすめの電子帳票システム5選を紹介します。各サービスの料金プランとおすすめポイントをまとめているので、ぜひ電子帳票システム比較選定の参考にしてください。

以上、機能比較や料金比較でおすすめの電子帳票システムを詳しく解説しました。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、電子帳票システム選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのツールがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

電子帳票システムとは

電子帳票システムとは、企業で扱われる帳票を電子化し、一元的に管理できるシステムです。取引で発生する帳票作成や送付作業、受領した書類の管理まですべてシステム上で行うことで、帳票管理を効率化できます。

2022年1月に「電子帳簿保存法」が改正され、電子取引における電子データの保存が義務化されました（2023年12月31日までは宥恕（ゆうじょ）措置がありましたが、2024年1月1日からは、宥恕措置はなくなり電子取引における帳票の電子化が義務付けられました）。

こうした国の動きに対応するため、電子帳簿保存法に対応できる電子帳票システムに対するニーズが高まっています。

実際に、電子帳簿保存法に対応している電子帳票システムの認証機関「JIIMA」が企業に対して行った調査では、「電子帳簿保存法に対応したサービスを導入する予定はありますか？」という質問に対し、27.5%の企業が「すでに導入している」、52.2%が「導入を検討している」という回答がありました。

また、同調査の中で、「電子帳簿保存法に対応したサービスの導入を検討している、または導入している企業」のうち約半数がクラウドサービスを選ぶという結果となっています。クラウドを選ぶ理由としては「運用負荷が抑えられるから」が42.7％と最も多く、次いで「運用が容易だから」（36.5％）、「テレワークの需要があったから」（36.5％）という理由が多いです。

これらの調査からもわかる通り、電子帳簿保存法に対応した電子帳票システムが多くの企業から必要とされており、特に、運用負荷の軽減やテレワークを導入したい企業には、クラウド型の電子帳票システムがおすすめと言えます。

電子帳票システムの搭載機能は、以下の「発行」「配信」「管理」の3つに分類されます。

電子帳票システムを選ぶ際のポイント

電子帳票システムの導入を成功させるには、価格だけでなく、下記のポイントを押さえた比較が必要です。

電子帳簿保存法では、帳票を電子保存する際の要件として「真実性」と「可視性」の確保が定められています。

真実性を確保するには、タイムスタンプが付与できること、又は訂正・削除の履歴が残せるしくみが必要です。可視性の確保では一定条件によって検索・出力ができなければなりません。電子帳簿保存法に対応した電子帳票システムなら、これらの要件を満たした状態で運用可能です。

なお、電子帳票システムが電子帳簿保存法に対応しているか判断する際は、JIIMA認証ロゴの有無を確認しましょう。JIIMA認証を取得したシステムは、電子帳簿保存法の法的要件を満たしている証明です。JIIMA認証を受けた電子帳票システムは、公式サイトに認証ロゴを表示できるので簡単に見分けられます。

電子帳票システムの導入費用の比較も重要ですが、効果が得られなければ意味がありません。電子帳票システムの導入で、下記のような効果が見込めます。

まずは、定量的な効果です。毎月発生する請求書を電子帳票システムで自動発行することで、今まで作業していた従業員分の人件費の削減ができます。今までの紙での帳票管理から電子データに移行すれば、ペーパーレス化による経費削減効果もあります。

定性的な効果では、電子帳簿保存法への対応による内部統制強化が可能です。請求書や見積書等の取引書類だけでなく国税関係帳簿を含めてシステム上で管理できるので、電子帳簿保存法への対応だけでなく、リモートワークなどのワークスタイルへの変化にも対応できます。

このように、電子帳票システムの導入費用に対して、どのような効果があるか把握しておくことが重要です。

電子帳票システムの比較では、導入・運用サポート体制の確認も重要です。適切なサポートがあれば、業務が滞ることなく円滑に電子帳票システムを運用できます。

たとえば、導入時の設定はどこまで対応できるかがポイントです。会社情報などの基本設定はもちろん、ユーザーや取引先、ワークフローまで登録依頼できれば、手間をかけずに運用を開始できます。とくに外部システムとの連携は複雑な設定を伴うこともあるため、事前にサポート範囲を確認する必要があります。

また、導入後の問い合わせ方法も確認するべきポイントです。電話やメール、チャット、訪問など複数の連絡手段が使えることはもちろん、サポートできる時間帯や緊急時の対応方法なども運用に影響します。円滑に運用するには、手厚いサポートが受けられる電子帳票システムがおすすめです。

以上、電子帳票システムの選び方を解説しました。別記事「電子帳票システムの選び方を解説｜法改正に対応したシステムも紹介」ではより詳しい選び方を解説しています。興味のある方はぜひご覧ください。

電子帳票システムのメリット

電子帳票システムを導入することで、以下のようなメリットが得られます。

電子帳票システムを使えば、帳票管理業務の自動化・効率化が可能です。

通常、取引先に紙帳票を送付する際は印刷・封入・投函などが発生しますが、電子帳票システムを使えばこれらの作業が不要になります。毎月発生する請求書は自動発行ができるほか、回覧や承認もすべてPC上で可能です。送付の際もメール・FAX・郵送代行から選んでクリックするだけで完了できるため、発送業務の工数削減につながります。

また、帳票の一元管理は追跡・検索時間の短縮にも効果的です。紙帳票は書庫の中からファイルを見つけ該当帳票を探すのにひと手間かかりますが、電子帳票システムなら瞬時に探し出せます。取引先からの再発行・訂正依頼はもちろん、監査の際もスピーディな対応が可能です。

ペーパーレス化により、経費節減できる点もメリットの一つです。

紙帳票では紙代やインク代、封筒代、送料などで多くのコストがかかりますが、電子帳票システムを使えばこれらの費用を抑えられます。送付原本とは別に控えを印刷する必要はなく、再発行・訂正もすべてペーパーレスで行えます。1件あたりは少額でも、年単位で見れば大きな経費削減につながります。

また、紙書類の管理は、ファイリングや保管、廃棄などで多くの手間がかかります。とくに法人では、国税関係書類に7年間の保管義務が設けられており、長期間に渡り管理し続けなければいけません。電子帳票システムを使えば管理にかかる負担が大幅に軽減され、人件費削減にも効果的です。

紙帳票では不正な持ち出しや紛失などのリスクを伴いますが、システムで管理すればセキュリティ強化が可能です。

多くの電子帳票システムでは、セキュリティを高める機能が搭載されています。たとえば、データの種類毎にアクセスできるユーザーや操作の制限が可能です。閲覧や印刷、コピーなども全てログが残るため、問題が生じた際もスピーディに対応できます。さらにタイムスタンプを付与することで改ざん防止にも効果的です。

また、電子帳票システムではSSLによる暗号化や2段階認証、不正アクセス防止などが対策され、外部からの攻撃にも備えられます。24時間365日の監視体制で常時バックアップが行われているため、紙管理よりもセキュリティの高い環境で運用可能です。

まとめ：価格を抑えて電子帳票システムを導入しよう

電子帳票システムを選ぶには、各製品の料金や特徴を把握し、自社の目的や予算に合った会社を見つけることが大切です。PRONIアイミツでは、さまざまな条件で電子帳票システムを比較できます。電子帳簿保存法への対応や無料プランの有無など、あなたの会社に最適なサービスを機能1つから探すことができます。

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しかし、電子帳簿保存法対応の電子帳票システムは多数あり、どれを導入すべきか迷ってしまうでしょう。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、電子帳票システム選びについての相談を受け付けています。いくつかの質問に答えるだけで希望要件に合った電子帳票システムが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。