EC一元管理システム比較7選！ネットショップの受注管理を効率化

目次
• EC一元管理システムの選び方・比較ポイント
• EC一元管理システムの比較表
• 【2025年最新】おすすめEC一元管理システム7選
• EC一元管理システムとは
• EC一元管理システムで受注管理するメリット
• EC一元管理システムのデメリット
• まとめ：ネットショップの受注管理はシステム導入がおすすめ

EC一元管理システムの選び方・比較ポイント

EC一元管理システムとは、複数のECモール・ECカートにおける受発注管理を一元化できるシステムです。Amazon・楽天市場・Yahoo!ショッピングなどのECモールやECカートを一元管理することで、EC業務を効率化できます。

近年、EC事業の市場規模の増加に比例して、EC一元管理システムの需要も高まっています。実際に、「EC管理システムを導入したことがあり、月商100万円以上を達成したEC事業者100名」を対象にNE株式会社が2023年に実施した調査では、EC事業開始1か月以内のEC一元管理システムの導入率は約60％。期間全体で見るとEC一元管理システムの導入率は92％と高いことがわかりました。

出典：株式会社NE「月商100万円以上のEC事業者の6割はEC事業開始1ヶ月以内にシステムを導入していた」

以上の調査から、EC事業を成功させるうえで、システムの迅速な導入が重要であることがわかります。

しかし、EC一元管理システムは各社からさまざまなサービスが提供されており、どれを選べばいいかわからない方も多いでしょう。そこでここでは、自社に合うEC一元管理システムを選び方・比較選定ポイントを解説します。

EC一元管理システムを比較選定する際には、初期費用・月額料金・従量課金などの料金体系が予算に合うかどうかを確認しておきましょう。

EC一元管理システムは、提供会社によって料金体系が異なります。たとえば、商品登録数や受注件数に応じて料金が加算される従量課金プランや、決められた件数までは定額で利用できるプランなどがあります。店舗数が増えると追加費用が発生するプランもあり、店舗を増やす予定の企業は予算の設定に注意が必要です。

EC一元管理システムは他のシステムと連携で、よりスムーズに業務を行えます。たとえば、倉庫管理システムと連携すると、ネットショップ上の在庫と商品の詳細な情報の連動が可能です。また、POSシステムと連携すると、実店舗の在庫や売上データの共有ができます。

EC一元管理システムは、連携できる外部サービスが異なるため、連携したいシステムがある場合は事前に連携できる範囲を確認しておきましょう。特に自社独自のネットショップやシステムを保有しているなら、カスタマイズ性が高く、他のシステムとの連携範囲が広いEC一元管理システムがおすすめです。

EC一元管理システムは、システムごとに対応できるECモール・カートが異なります。導入前には必ず、自社が利用しているECモール・カートに対応しているか確認しておきましょう。

ほとんどのEC一元管理システムでは、Amazon・楽天市場・Yahoo!ショッピングなどの主要ECモールに対応しています。その中でも、越境ECモールに強みを持つシステムや、多くのファッション系ECモールに対応したシステムなど、各システムで対応ECモール・カートが異なるため、事前に確認しましょう。

また、将来的な事業拡大で出店ECモール・カートを増やす予定があるなら、多くのECモール・カートに対応したEC一元管理システムの導入がおすすめです。

IT導入補助金を利用すれば、導入コストを抑えてEC一元管理システムを導入できます。しかし、すべてのシステムでIT導入補助金を適用できるわけではありません。経済産業省が定める要件を満たし、IT導入補助金の対象として認められたツールを導入する場合のみ補助金を受けられます。

IT導入補助金を受けたい場合は、新しく導入するシステムがIT導入補助金を適用できるかどうかを確認しておきましょう。特に、新しく事業を始める際にはさまざまなコストを要するため、IT導入補助金を利用できるEC一元管理システムの導入をおすすめします。

EC一元管理システムには、導入前にお試しで操作できる無料トライアルを利用できるものがあります。おすすめのEC一元管理システムでは、約1ヶ月間の無料トライアルを利用できるものが多いです。無料トライアル期間中は、本格導入後に利用する従業員に利用してもらい、画面の見やすさや操作のしやすさなどを確認しましょう。会社の規模が大きく、導入後にEC一元管理システムを操作する人数が多い場合は、無料トライアル期間中の利用スケジュールを事前に決めておくのがおすすめです。  

上記の通り、EC一元管理システムは比較ポイントが多いため「自社にあったおすすめのシステムはどれか」と悩む方も多いです。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、EC一元管理システム選びについての相談を受け付けています。以下のボタンからいくつかの質問に答えるだけで希望要件に合ったEC一元管理システムが分かる診断（無料）もありますので、ぜひ一度お試しください。

EC一元管理システムの比較表

ここでは、おすすめのEC一元管理システムの導入にかかる費用（初期費用・月額料金）を比較しています。無料トライアル期間もまとめているので、EC一元管理システムの比較選定の際にぜひご活用ください。

おすすめのEC一元管理システムでは、TEMPOSTAR、ネクストエンジン、CROSS MALL、LOGILESSが初期費用無料で導入できます。GoQSystemの初期費用は30,000円ですが、「フリープラン」では受注件数100件まで初期費用・月額料金が無料のため、受注件数が少ない企業におすすめです。

助ネコEC管理システム、ネクストエンジン、CROSS MALLの月額料金は、他社と比較して5,000円以下と安い料金で運用できるため、ランニングコストを抑えたい企業におすすめのEC一元管理システムです。

【2025年最新】おすすめEC一元管理システム7選

ここでは、2025年最新のEC一元管理システムを紹介します。各サービスの特徴や強み、料金などを紹介していますので、ぜひサービス選びにお役立てください。

以上、機能比較や料金比較でおすすめのEC一元管理システムを詳しく解説しました。PRONIアイミツ（当サイト）では、ITツール受発注支援のプロとして、EC一元管理システム選びの相談を承っています。いくつかの質問に答えるだけで自社におすすめのツールがわかる診断（無料）も用意していますのでぜひご活用ください。

EC一元管理システムとは

EC一元管理システムとは、複数のECサイト（ネットショップ）の受注処理や在庫状況をまとめて管理できるシステムです。各店舗の情報を一元管理できるため、ネットショップを多店舗展開している企業でもスムーズな運用が実現します。

さらに、複数のECサイトへの商品登録を一括で行える「商品登録機能」や、顧客にメールを自動で送信できる「問い合わせ機能」もあり、ネットショップの受注管理にかかる手間と時間を大幅に削減可能。

EC一元管理システムは、店舗数や取り扱い商品が多く、ネットショップの受注管理を負担に感じている方におすすめです。

EC一元管理システムで受注管理するメリット

ここからは、EC一元管理システムを導入する主なメリットを詳しく解説します。EC一元管理システムの導入を検討中の方はご参考にしてください。

EC一元管理システムを使用することで、ネットショップの受注管理を効率化できます。加えて商品情報や在庫情報など、複数のECモール・ECカートにまたがる業務を一つのシステムで管理できるようになります。そのため、データの入力作業の重複を避け、作業効率向上が可能です。

また管理の自動化で時間を節約することで、新しいECモールへの出店による販路拡大など、ほかの業務に集中できるようにもなります。

一元管理システムを導入することで、売り上げアップが目指せます。複数のECモールを一元管理することで、リアルタイムでの在庫管理が可能です。これにより、在庫切れによる販売機会の損失を防ぎ、顧客からの信頼性の向上、売上の増加が期待できます。

EC一元管理システムでは、ヒューマンエラーを防止できます。手作業によるデータ入力や管理は、ミスが発生しやすいものです。EC一元管理システムを使用することで、複数のECモールの管理データを自動で更新可能。誤った在庫情報の表示や、受注ミスなどのヒューマンエラーを減らせます。

EC一元管理システムでは、効率的な在庫管理や迅速なメール対応、正確な在庫情報を顧客に提供できるため、顧客満足度の向上が期待できます。たとえば、顧客情報も管理できるので、顧客一人一人に最適化された案内メールの送信が可能。顧客ロイヤルティの向上やリピート購入の促進が可能です。

EC一元管理システムのデメリット

EC一元管理システムには多くのメリットがある一方で、デメリットもあります。EC一元管理システムを導入する際は、次の点に注意してください。

EC一元管理システムのデメリットは、導入コスト・運用費がかかることです。EC一元管理システムにかかるコストは主に、初期費用、月額料金、従量課金があります。特に注意が必要なのは、従量課金。商品登録数や受注件数、管理するECモールが増えると料金が加算されるものなど、各システムごとに料金体系が異なるので、導入前に確認が必要です。

また、無料プランを用意しているものや、初期費用無料のものもあるので、長期的な運用コストを念頭に予算に合わせたシステムを比較検討しましょう。

業務フローを変更する必要があるのも、EC一元管理システム導入のデメリットです。システムを導入するとネットショップの受注管理を効率化できる反面、今までの業務フローを大幅に変える必要があるため、抵抗感のある従業員もいるでしょう。従業員や操作マニュアルの作成や操作研修やシステム管理者の決定など、体制を整えておくことが大切です。社内のリソースがなくそこまで手が回せない場合は、システムのサポートページの活用や、サポートが充実している提供会社の選定がおすすめです。

まとめ：ネットショップの受注管理はシステム導入がおすすめ

EC一元管理システムは、複数のネットショップを効率的に運用するための便利な機能が多くあります。注文数や取り扱い商品が多い企業でも、EC一元管理システムを利用すれば、ネットショップの受注管理の負担を大幅に軽減可能です。

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